More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1436 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  100 
 
 		 527 aa  1031    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  76.19 
 
 		 527 aa  797    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  63.43 
 
 		 535 aa  643    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  59.51 
 
 		 531 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  57.41 
 
 		 530 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  56.6 
 
 		 545 aa  559  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  57.79 
 
 		 534 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  53.9 
 
 		 524 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  54.48 
 
 		 525 aa  520  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  54.86 
 
 		 531 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  52.85 
 
 		 532 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  50.67 
 
 		 533 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  54.67 
 
 		 534 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  46.96 
 
 		 526 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 524 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  36.91 
 
 		 534 aa  359  5e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0084  ABC transporter related  97.99 
 
 		 209 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.62 
 
 		 536 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  41.42 
 
 		 554 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  39.77 
 
 		 536 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  41.12 
 
 		 535 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  38.73 
 
 		 541 aa  307  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  39 
 
 		 553 aa  306  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  41.21 
 
 		 549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  38.78 
 
 		 557 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  39.89 
 
 		 544 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  41.34 
 
 		 516 aa  290  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  38.16 
 
 		 539 aa  289  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  37.03 
 
 		 558 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.27 
 
 		 538 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  39.81 
 
 		 537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  39.81 
 
 		 537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  39.81 
 
 		 537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  40.07 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 548 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  37.92 
 
 		 548 aa  280  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  38.35 
 
 		 555 aa  276  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 548 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 548 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 548 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 548 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 548 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 548 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 548 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  41.28 
 
 		 565 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  38.33 
 
 		 532 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  37.62 
 
 		 541 aa  274  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  35.8 
 
 		 530 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  37.55 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  37.31 
 
 		 546 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  37.5 
 
 		 548 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  32.7 
 
 		 529 aa  266  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  37.11 
 
 		 551 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  37.11 
 
 		 551 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  37.5 
 
 		 550 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  30.65 
 
 		 528 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  35.5 
 
 		 541 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  28.84 
 
 		 529 aa  257  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  35.42 
 
 		 525 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  36.91 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  32.14 
 
 		 530 aa  250  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  35.66 
 
 		 535 aa  247  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  35.5 
 
 		 525 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  34.65 
 
 		 531 aa  246  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  31.97 
 
 		 529 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  33.27 
 
 		 523 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 529 aa  239  6.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.27 
 
 		 531 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  37.34 
 
 		 530 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  37.83 
 
 		 520 aa  233  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  34.57 
 
 		 535 aa  232  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  34.48 
 
 		 627 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  32.09 
 
 		 436 aa  212  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  34.27 
 
 		 627 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  30.26 
 
 		 580 aa  206  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  29.51 
 
 		 519 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  34.94 
 
 		 627 aa  204  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  34.57 
 
 		 542 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.68 
 
 		 639 aa  203  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  33.67 
 
 		 619 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  35.29 
 
 		 537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.66 
 
 		 644 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  33.86 
 
 		 625 aa  197  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.8 
 
 		 550 aa  197  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  31.4 
 
 		 632 aa  195  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.04 
 
 		 634 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  30.2 
 
 		 641 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  33.33 
 
 		 627 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  31.49 
 
 		 637 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  34.31 
 
 		 625 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.8 
 
 		 643 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  29.47 
 
 		 577 aa  190  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.6 
 
 		 558 aa  189  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 627 aa  189  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  26.89 
 
 		 639 aa  189  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  32.54 
 
 		 554 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.13 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 640 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.09 
 
 		 561 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  33.15 
 
 		 649 aa  187  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>