More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0963 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  100 
 
 
526 aa  1054    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  50.38 
 
 
531 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  49.81 
 
 
530 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  50.19 
 
 
527 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  50.57 
 
 
534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  50 
 
 
532 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  47.15 
 
 
535 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  46.67 
 
 
545 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  46.6 
 
 
531 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  45.59 
 
 
524 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  45.06 
 
 
533 aa  435  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  47.15 
 
 
525 aa  425  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  46.96 
 
 
527 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  46.79 
 
 
534 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 
524 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  35.36 
 
 
534 aa  350  4e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  38.83 
 
 
541 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  38.97 
 
 
541 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.2 
 
 
536 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 
544 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  38.72 
 
 
535 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  32.39 
 
 
529 aa  319  7.999999999999999e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  40.07 
 
 
537 aa  316  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  40.07 
 
 
537 aa  316  8e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  40.07 
 
 
537 aa  316  8e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  38.15 
 
 
554 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  32.33 
 
 
529 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  39.89 
 
 
549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  38.04 
 
 
557 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  38.64 
 
 
553 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  37.19 
 
 
536 aa  299  9e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  33.15 
 
 
529 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  31.13 
 
 
528 aa  289  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  37.98 
 
 
516 aa  286  8e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  37.24 
 
 
555 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  37.24 
 
 
553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  31.83 
 
 
529 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  35.74 
 
 
539 aa  281  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  39.38 
 
 
565 aa  279  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  35.82 
 
 
548 aa  279  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  30.75 
 
 
530 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  35.04 
 
 
558 aa  276  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.09 
 
 
538 aa  276  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  35.17 
 
 
546 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  35.85 
 
 
550 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  33.97 
 
 
535 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  34.95 
 
 
530 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  38.16 
 
 
532 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  35.59 
 
 
551 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  35.59 
 
 
551 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  35.17 
 
 
546 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  34.91 
 
 
511 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  34.27 
 
 
548 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  36.53 
 
 
520 aa  249  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  33.71 
 
 
523 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.34 
 
 
548 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  35.13 
 
 
530 aa  243  7.999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
548 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
548 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
548 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  34.53 
 
 
535 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
548 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
548 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
548 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
548 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  31.95 
 
 
531 aa  239  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  33.08 
 
 
541 aa  239  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  30.38 
 
 
531 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  33.21 
 
 
525 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  29.83 
 
 
519 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  33.46 
 
 
525 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  33.21 
 
 
625 aa  224  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  33.64 
 
 
625 aa  223  9e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.64 
 
 
634 aa  223  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  30.97 
 
 
580 aa  221  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  33.27 
 
 
627 aa  220  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  32.84 
 
 
627 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  33.08 
 
 
640 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  33.27 
 
 
627 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  33.08 
 
 
627 aa  217  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  30.94 
 
 
637 aa  214  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.57 
 
 
634 aa  213  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.78 
 
 
639 aa  212  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.4 
 
 
639 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.78 
 
 
643 aa  211  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  31.08 
 
 
636 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.03 
 
 
668 aa  210  5e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  33.02 
 
 
627 aa  209  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  33.85 
 
 
634 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  32.1 
 
 
625 aa  209  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.12 
 
 
532 aa  209  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  30.68 
 
 
436 aa  206  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  31.77 
 
 
625 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.33 
 
 
641 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.49 
 
 
644 aa  203  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.41 
 
 
659 aa  203  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2962  ABC transporter related  31.95 
 
 
619 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0574525  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  31.7 
 
 
532 aa  202  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  31.73 
 
 
626 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  30.98 
 
 
627 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>