More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2973 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  73.18 
 
 		 548 aa  697    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  72.81 
 
 		 548 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  89.42 
 
 		 548 aa  937    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  97.8 
 
 		 546 aa  1003    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  73.72 
 
 		 548 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  89.11 
 
 		 551 aa  919    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  73.18 
 
 		 548 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  100 
 
 		 546 aa  1067    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  89.11 
 
 		 551 aa  919    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  73.18 
 
 		 548 aa  697    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  90 
 
 		 550 aa  919    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  73.18 
 
 		 548 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  73.18 
 
 		 548 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  73.18 
 
 		 548 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  55.31 
 
 		 541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  51.78 
 
 		 539 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  47.46 
 
 		 557 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.11 
 
 		 536 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  46.37 
 
 		 553 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.74 
 
 		 538 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  47.31 
 
 		 532 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  42.2 
 
 		 530 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  44.32 
 
 		 525 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  43.16 
 
 		 525 aa  343  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  41.28 
 
 		 535 aa  312  9e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  39.92 
 
 		 541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  38.22 
 
 		 541 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 		 544 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 535 aa  300  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  37.2 
 
 		 527 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  39.66 
 
 		 533 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  40.26 
 
 		 525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  32.2 
 
 		 534 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  36.93 
 
 		 535 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  41.54 
 
 		 534 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  36.23 
 
 		 558 aa  279  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  38.07 
 
 		 554 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  40.8 
 
 		 537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  40.8 
 
 		 537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  35.44 
 
 		 531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  36.99 
 
 		 524 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  40.8 
 
 		 537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  39.73 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  35.17 
 
 		 526 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  36.78 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  35.86 
 
 		 530 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  36.63 
 
 		 545 aa  269  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  39.02 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  39.1 
 
 		 555 aa  264  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.66 
 
 		 531 aa  262  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  37.24 
 
 		 527 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  36.81 
 
 		 532 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  40.76 
 
 		 534 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  36.68 
 
 		 536 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 548 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  36.52 
 
 		 535 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 524 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  38.39 
 
 		 565 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 520 aa  241  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  33.27 
 
 		 523 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  27.15 
 
 		 529 aa  239  9e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  33.82 
 
 		 531 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  37.52 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  28.91 
 
 		 528 aa  229  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  28.39 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  29.81 
 
 		 529 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  28.62 
 
 		 530 aa  223  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  29.03 
 
 		 529 aa  213  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 530 aa  212  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  31.91 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30.06 
 
 		 636 aa  203  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  28.44 
 
 		 645 aa  203  7e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.33 
 
 		 634 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.03 
 
 		 643 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  32.92 
 
 		 649 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  33.03 
 
 		 649 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  32.19 
 
 		 649 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  29.01 
 
 		 639 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  28.02 
 
 		 613 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.86 
 
 		 634 aa  194  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  30.71 
 
 		 519 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  33.15 
 
 		 636 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  32.22 
 
 		 642 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  32.17 
 
 		 661 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.73 
 
 		 644 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  32.17 
 
 		 661 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  31.07 
 
 		 530 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.56 
 
 		 641 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  31.99 
 
 		 649 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  31.99 
 
 		 545 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  30.4 
 
 		 637 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  33.83 
 
 		 537 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  32.42 
 
 		 641 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  30.4 
 
 		 637 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  32.43 
 
 		 648 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  30.4 
 
 		 637 aa  188  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  31.95 
 
 		 641 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  32.43 
 
 		 645 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.85 
 
 		 550 aa  187  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>