More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2860 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21470  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  80.23 
 
 		 529 aa  862    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  100 
 
 		 530 aa  1075    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.36 
 
 		 634 aa  335  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  34.94 
 
 		 767 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  34.99 
 
 		 581 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  36.33 
 
 		 540 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  32.3 
 
 		 639 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  35.25 
 
 		 540 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  35.18 
 
 		 540 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  32.19 
 
 		 634 aa  302  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  34.99 
 
 		 540 aa  301  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  35.47 
 
 		 540 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  34.56 
 
 		 690 aa  300  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 		 540 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  36.76 
 
 		 549 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  34.38 
 
 		 672 aa  298  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.87 
 
 		 541 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  31.51 
 
 		 666 aa  296  7e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  33.71 
 
 		 638 aa  296  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.04 
 
 		 548 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  36.95 
 
 		 543 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.46 
 
 		 709 aa  294  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.79 
 
 		 575 aa  294  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  36.49 
 
 		 540 aa  294  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  36.98 
 
 		 544 aa  293  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  34.97 
 
 		 545 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.85 
 
 		 548 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  35.66 
 
 		 540 aa  292  9e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  33.53 
 
 		 555 aa  292  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  34.73 
 
 		 560 aa  292  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.58 
 
 		 668 aa  292  1e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  35.25 
 
 		 540 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.36 
 
 		 561 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.29 
 
 		 559 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.85 
 
 		 548 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  34.67 
 
 		 564 aa  291  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  35.71 
 
 		 540 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  35.74 
 
 		 540 aa  291  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.11 
 
 		 540 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  36.9 
 
 		 545 aa  289  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  32.02 
 
 		 535 aa  288  1e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.4 
 
 		 558 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  34.81 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  36.17 
 
 		 567 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.35 
 
 		 557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  36.12 
 
 		 540 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  35.63 
 
 		 542 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.35 
 
 		 557 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  35.14 
 
 		 540 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.96 
 
 		 559 aa  286  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  33.84 
 
 		 565 aa  286  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.16 
 
 		 558 aa  286  9e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  35.36 
 
 		 540 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  34.09 
 
 		 545 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.34 
 
 		 555 aa  283  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  33.27 
 
 		 638 aa  283  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  35.71 
 
 		 540 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  33 
 
 		 555 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  32.06 
 
 		 641 aa  283  6.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.2 
 
 		 556 aa  282  8.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 		 561 aa  282  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.31 
 
 		 560 aa  282  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 558 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  33.08 
 
 		 649 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  34.35 
 
 		 653 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  34.65 
 
 		 641 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  35.82 
 
 		 574 aa  280  3e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.58 
 
 		 645 aa  280  4e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  31.55 
 
 		 643 aa  280  4e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.38 
 
 		 561 aa  280  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.43 
 
 		 554 aa  280  6e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.99 
 
 		 561 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  32.02 
 
 		 663 aa  279  9e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.94 
 
 		 555 aa  279  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.75 
 
 		 557 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  34.43 
 
 		 540 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  34.56 
 
 		 539 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3678  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.67 
 
 		 555 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  33.52 
 
 		 667 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.69 
 
 		 558 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  31.26 
 
 		 623 aa  277  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  34.99 
 
 		 543 aa  278  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  34.36 
 
 		 636 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.34 
 
 		 578 aa  277  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  32.1 
 
 		 632 aa  278  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  34.1 
 
 		 575 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3872  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.67 
 
 		 555 aa  277  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0797074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  34.21 
 
 		 630 aa  277  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  32.06 
 
 		 663 aa  276  5e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  33.97 
 
 		 637 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  32.81 
 
 		 555 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  32.95 
 
 		 640 aa  276  5e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.85 
 
 		 559 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  31.93 
 
 		 685 aa  276  8e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  30.8 
 
 		 627 aa  276  8e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  32.89 
 
 		 630 aa  276  8e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  32.31 
 
 		 649 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.31 
 
 		 559 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  33.53 
 
 		 636 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  35.28 
 
 		 564 aa  275  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>