More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3897 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  100 
 
 		 613 aa  1251    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  50.62 
 
 		 643 aa  623  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  50.39 
 
 		 642 aa  618  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  49.07 
 
 		 653 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 		 642 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  46.62 
 
 		 639 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  47.99 
 
 		 630 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 631 aa  569  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  47.52 
 
 		 631 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 631 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 		 631 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 631 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 631 aa  566  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 		 631 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 631 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  46.28 
 
 		 631 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  44.63 
 
 		 642 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  45.27 
 
 		 646 aa  539  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  44.98 
 
 		 642 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  44.63 
 
 		 642 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  44.93 
 
 		 631 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  42.72 
 
 		 629 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  43.63 
 
 		 640 aa  521  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  43.21 
 
 		 632 aa  513  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  42.24 
 
 		 636 aa  511  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  42.12 
 
 		 632 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 629 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  42.06 
 
 		 630 aa  489  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  40 
 
 		 630 aa  486  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 622 aa  476  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  42.14 
 
 		 622 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  41.08 
 
 		 641 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  39.19 
 
 		 621 aa  469  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  39.15 
 
 		 630 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  41.73 
 
 		 620 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  39.44 
 
 		 626 aa  464  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  40.06 
 
 		 631 aa  457  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  40.91 
 
 		 630 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  38.86 
 
 		 641 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  39.02 
 
 		 652 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  41.55 
 
 		 626 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  38.24 
 
 		 625 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  38.71 
 
 		 641 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  38.24 
 
 		 625 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 		 627 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 		 622 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  38.79 
 
 		 634 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  37.71 
 
 		 633 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  39.16 
 
 		 620 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  38.15 
 
 		 623 aa  427  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  37.4 
 
 		 631 aa  429  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  38.81 
 
 		 644 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  37.89 
 
 		 625 aa  426  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  37.13 
 
 		 636 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.75 
 
 		 559 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  41.05 
 
 		 623 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 		 555 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  35.83 
 
 		 634 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  35.56 
 
 		 633 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.62 
 
 		 551 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.21 
 
 		 555 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.98 
 
 		 551 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0447  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.21 
 
 		 570 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46914  normal  0.303037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 555 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.33 
 
 		 551 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  34.94 
 
 		 632 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.41 
 
 		 554 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 555 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 555 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 705 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3463  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 550 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427951  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.09 
 
 		 555 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2713  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.83 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 592 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2900  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.84 
 
 		 554 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196259 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004402  ABC transporter ATP-binding protein  38.3 
 
 		 555 aa  379  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485845  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 554 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.26 
 
 		 555 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.17 
 
 		 670 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 555 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4057  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.71 
 
 		 554 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.21 
 
 		 555 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.97 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  37.61 
 
 		 608 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 		 550 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.74 
 
 		 555 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00997  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.09 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4024  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.52 
 
 		 554 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.640286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>