More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2310 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  72.64 
 
 
548 aa  693    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  72.64 
 
 
548 aa  693    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  97.46 
 
 
550 aa  1008    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  72.28 
 
 
548 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  89.66 
 
 
548 aa  947    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  73.06 
 
 
548 aa  727    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  100 
 
 
551 aa  1081    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  89.29 
 
 
546 aa  909    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  89.47 
 
 
546 aa  905    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  100 
 
 
551 aa  1081    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  72.64 
 
 
548 aa  693    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  72.64 
 
 
548 aa  693    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  72.64 
 
 
548 aa  693    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  72.64 
 
 
548 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  55.09 
 
 
541 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  51.76 
 
 
539 aa  508  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  46.64 
 
 
557 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 
536 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  45.32 
 
 
553 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.1 
 
 
538 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  46.01 
 
 
532 aa  364  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  39.89 
 
 
530 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  42.18 
 
 
525 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  41.44 
 
 
525 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  40.37 
 
 
535 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  36.95 
 
 
541 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 
544 aa  293  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  37.9 
 
 
541 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  38.4 
 
 
535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  38.21 
 
 
533 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  37.24 
 
 
535 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  39.92 
 
 
525 aa  280  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  36.01 
 
 
531 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  37.57 
 
 
545 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  35.56 
 
 
527 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  35.59 
 
 
526 aa  274  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  31.14 
 
 
534 aa  273  7e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  34.94 
 
 
558 aa  269  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  36.64 
 
 
524 aa  269  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  38.29 
 
 
549 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  35.62 
 
 
530 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  39.09 
 
 
537 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  39.09 
 
 
537 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  39.09 
 
 
537 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  37.13 
 
 
554 aa  264  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.4 
 
 
531 aa  261  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  38.67 
 
 
534 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  35.21 
 
 
531 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  36.67 
 
 
532 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  37.71 
 
 
553 aa  257  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  37.48 
 
 
555 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  28.7 
 
 
529 aa  250  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  36.62 
 
 
527 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  39.7 
 
 
534 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.09 
 
 
524 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  35.37 
 
 
536 aa  237  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  31.91 
 
 
523 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  37.64 
 
 
565 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  35.88 
 
 
520 aa  231  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  27.73 
 
 
529 aa  230  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  29.62 
 
 
528 aa  231  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  33.4 
 
 
548 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  33.21 
 
 
531 aa  227  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  29.62 
 
 
529 aa  226  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  34.07 
 
 
535 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  28.88 
 
 
530 aa  224  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  36.38 
 
 
516 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  28.76 
 
 
529 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  34.25 
 
 
530 aa  216  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  31.28 
 
 
436 aa  210  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  32.67 
 
 
649 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.6 
 
 
634 aa  199  9e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  32.49 
 
 
649 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  32.01 
 
 
649 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  28.18 
 
 
645 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  33.75 
 
 
642 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  31.77 
 
 
661 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  31.77 
 
 
661 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 
636 aa  194  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  31 
 
 
645 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  31.59 
 
 
649 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  31.72 
 
 
648 aa  193  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.77 
 
 
643 aa  193  8e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  32.67 
 
 
688 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  33.7 
 
 
537 aa  191  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  32.98 
 
 
641 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  29.25 
 
 
519 aa  190  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  32.74 
 
 
636 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 
648 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.86 
 
 
634 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  28.18 
 
 
636 aa  188  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  32.34 
 
 
629 aa  188  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  35.37 
 
 
651 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  31.15 
 
 
637 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  31.15 
 
 
637 aa  187  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  31.15 
 
 
637 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  32.5 
 
 
641 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  32.01 
 
 
663 aa  187  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 
660 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 
660 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>