More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0461 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  100 
 
 		 531 aa  1049    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  64.19 
 
 		 530 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  64.19 
 
 		 531 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  56.95 
 
 		 532 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  58.1 
 
 		 534 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  55.89 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  54.37 
 
 		 527 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  53.23 
 
 		 533 aa  528  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  53.45 
 
 		 524 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  55.89 
 
 		 525 aa  526  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  54.86 
 
 		 527 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  50.57 
 
 		 545 aa  478  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  53.14 
 
 		 534 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  46.6 
 
 		 526 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  39.35 
 
 		 534 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 524 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  42.4 
 
 		 537 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  42.4 
 
 		 537 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  42.4 
 
 		 537 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  40.75 
 
 		 536 aa  324  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.81 
 
 		 536 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  38.93 
 
 		 554 aa  319  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  38.84 
 
 		 541 aa  319  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  40.38 
 
 		 541 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  38.75 
 
 		 535 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 544 aa  310  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  40.64 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  40.34 
 
 		 557 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  37.84 
 
 		 558 aa  296  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  37.26 
 
 		 539 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  38.81 
 
 		 553 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  37.87 
 
 		 555 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  39.1 
 
 		 565 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  37.16 
 
 		 553 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.81 
 
 		 538 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  36.16 
 
 		 548 aa  273  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  36.07 
 
 		 546 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  36.26 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  30.42 
 
 		 529 aa  270  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  37.38 
 
 		 516 aa  269  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 535 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 548 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  35.42 
 
 		 530 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  34.69 
 
 		 551 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  35.83 
 
 		 550 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  34.69 
 
 		 551 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  29.94 
 
 		 529 aa  262  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  31.19 
 
 		 530 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  35 
 
 		 531 aa  260  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 548 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 548 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 548 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 548 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 548 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 548 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 548 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  30.06 
 
 		 528 aa  259  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 511 aa  258  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  32.5 
 
 		 529 aa  253  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  32.9 
 
 		 548 aa  249  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 530 aa  249  9e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  36.35 
 
 		 520 aa  249  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  36.62 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  33.65 
 
 		 541 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  29.68 
 
 		 529 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  34.46 
 
 		 535 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  37.24 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 532 aa  230  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  30.69 
 
 		 531 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  30.21 
 
 		 580 aa  212  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  29.37 
 
 		 523 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.39 
 
 		 634 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 545 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  30.07 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.77 
 
 		 644 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  30.64 
 
 		 641 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  29.54 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.49 
 
 		 639 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  33.27 
 
 		 659 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.17 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  32.26 
 
 		 625 aa  197  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  34.35 
 
 		 542 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.15 
 
 		 550 aa  196  8.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.49 
 
 		 659 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.32 
 
 		 636 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.68 
 
 		 644 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30.09 
 
 		 636 aa  193  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  34.06 
 
 		 545 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.68 
 
 		 662 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 658 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  35.15 
 
 		 544 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.68 
 
 		 658 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 640 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 658 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  32.08 
 
 		 625 aa  192  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 		 659 aa  192  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 		 658 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  30.2 
 
 		 639 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  30.77 
 
 		 637 aa  191  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  27.95 
 
 		 577 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>