More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2539 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  100 
 
 		 531 aa  1069    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  61.19 
 
 		 535 aa  610  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  60 
 
 		 530 aa  557  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 554 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  49.9 
 
 		 520 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  46.46 
 
 		 536 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  44.59 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  43.06 
 
 		 558 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  44.55 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  42.8 
 
 		 541 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  43.23 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  43.23 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  43.23 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  41.73 
 
 		 541 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  42.64 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 		 544 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  43.26 
 
 		 516 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  43.76 
 
 		 511 aa  364  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  43.31 
 
 		 555 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  41.29 
 
 		 548 aa  354  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  40.64 
 
 		 565 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  36.67 
 
 		 557 aa  286  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.26 
 
 		 536 aa  277  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  35.28 
 
 		 530 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  35.96 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  31.26 
 
 		 534 aa  270  7e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  35.74 
 
 		 538 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  35.53 
 
 		 534 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  34.21 
 
 		 531 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  34.64 
 
 		 545 aa  257  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  35.22 
 
 		 531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  34.54 
 
 		 541 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  31.07 
 
 		 529 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  34.67 
 
 		 533 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  35.33 
 
 		 535 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  36.02 
 
 		 553 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  35.39 
 
 		 527 aa  250  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  34.85 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  29 
 
 		 529 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  34.22 
 
 		 524 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.58 
 
 		 548 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 		 548 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 		 548 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  32.77 
 
 		 548 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 		 548 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 		 548 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 		 548 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 		 548 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 		 548 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  35.7 
 
 		 525 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  33.77 
 
 		 530 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  28.95 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  31.07 
 
 		 526 aa  236  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  31.25 
 
 		 529 aa  236  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  28.84 
 
 		 528 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  33.09 
 
 		 532 aa  233  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  36.08 
 
 		 534 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  33.83 
 
 		 535 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  33.27 
 
 		 551 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  33.27 
 
 		 551 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  35.32 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  33.4 
 
 		 546 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  33.64 
 
 		 546 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  33.21 
 
 		 550 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  34.34 
 
 		 527 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  31.46 
 
 		 523 aa  220  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 		 524 aa  219  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  27.7 
 
 		 530 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  34.5 
 
 		 532 aa  212  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.81 
 
 		 644 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.89 
 
 		 641 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  28.57 
 
 		 645 aa  194  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.74 
 
 		 662 aa  193  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  29.8 
 
 		 646 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  31.18 
 
 		 656 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 		 644 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 644 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  29.55 
 
 		 638 aa  191  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  30.78 
 
 		 658 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 		 659 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 640 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 658 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 658 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 658 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.42 
 
 		 639 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 658 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.49 
 
 		 643 aa  188  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  27.31 
 
 		 634 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  29.71 
 
 		 659 aa  187  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  33.2 
 
 		 619 aa  186  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  30 
 
 		 537 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  28.6 
 
 		 531 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  30.38 
 
 		 641 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  31.99 
 
 		 632 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.46 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.98 
 
 		 551 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  32.45 
 
 		 644 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.68 
 
 		 539 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0365  ABC transporter related  27.86 
 
 		 510 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  28.92 
 
 		 635 aa  177  6e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>