More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0400 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  100 
 
 		 535 aa  1042    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.03 
 
 		 536 aa  435  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  49.72 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  48.1 
 
 		 525 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  48.07 
 
 		 525 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  46.09 
 
 		 530 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.35 
 
 		 538 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  45.69 
 
 		 553 aa  355  7.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  40.3 
 
 		 539 aa  330  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  41.12 
 
 		 548 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  40.78 
 
 		 541 aa  319  9e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  40.37 
 
 		 551 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  40.37 
 
 		 551 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.63 
 
 		 548 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  41.09 
 
 		 546 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  41.28 
 
 		 546 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  40.67 
 
 		 550 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 548 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  43.74 
 
 		 532 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  36.93 
 
 		 541 aa  293  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  35.98 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  39.07 
 
 		 533 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  37.95 
 
 		 549 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  37.07 
 
 		 525 aa  274  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  35.56 
 
 		 531 aa  274  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 		 544 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  31.29 
 
 		 534 aa  273  6e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  36.62 
 
 		 541 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  35.73 
 
 		 530 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  37.04 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 536 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  35.02 
 
 		 531 aa  264  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  36.14 
 
 		 545 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  35.24 
 
 		 548 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  36.36 
 
 		 523 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  35.4 
 
 		 535 aa  256  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 		 524 aa  256  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  35.82 
 
 		 524 aa  256  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  28.28 
 
 		 529 aa  255  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  34.53 
 
 		 526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  30.77 
 
 		 528 aa  253  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  28.41 
 
 		 529 aa  251  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  35.03 
 
 		 558 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  37.24 
 
 		 537 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  37.24 
 
 		 537 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  37.24 
 
 		 537 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  38 
 
 		 534 aa  249  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  35.47 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  37.74 
 
 		 565 aa  247  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  35.01 
 
 		 553 aa  246  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  34.6 
 
 		 531 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  34.1 
 
 		 535 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  31.82 
 
 		 529 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  34.65 
 
 		 531 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  35.59 
 
 		 555 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  36.47 
 
 		 516 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 520 aa  237  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  34.92 
 
 		 511 aa  236  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  35.26 
 
 		 532 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  30.34 
 
 		 530 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 535 aa  228  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  29.42 
 
 		 529 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  37.83 
 
 		 534 aa  226  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  30.95 
 
 		 519 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  34.49 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  33.45 
 
 		 545 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  35.23 
 
 		 542 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.94 
 
 		 550 aa  203  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  29.45 
 
 		 634 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  34.46 
 
 		 530 aa  201  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 		 545 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  34.63 
 
 		 569 aa  198  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.2 
 
 		 555 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  31.97 
 
 		 553 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  31.97 
 
 		 553 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  31.97 
 
 		 553 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  30.74 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  32.1 
 
 		 554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  34.15 
 
 		 553 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  31.68 
 
 		 550 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  33.27 
 
 		 551 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  29.89 
 
 		 632 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.29 
 
 		 659 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  30.36 
 
 		 540 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  28.73 
 
 		 636 aa  181  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  30.06 
 
 		 620 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  34.16 
 
 		 537 aa  179  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  30.17 
 
 		 540 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  31.26 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  33.21 
 
 		 544 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  32.88 
 
 		 537 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  26.73 
 
 		 641 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  30.02 
 
 		 544 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  31.21 
 
 		 615 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>