More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3386 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  100 
 
 		 516 aa  984    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  55.33 
 
 		 554 aa  498  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 536 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  53.44 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  51.42 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  48.33 
 
 		 558 aa  438  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  51.14 
 
 		 553 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  49.63 
 
 		 541 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  49.25 
 
 		 544 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  51.46 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 548 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  51.06 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  46.5 
 
 		 541 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  48.78 
 
 		 537 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  48.78 
 
 		 537 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  48.78 
 
 		 537 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  48.48 
 
 		 565 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  47.54 
 
 		 511 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  43.35 
 
 		 531 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  48.58 
 
 		 530 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  40.07 
 
 		 527 aa  312  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  39.81 
 
 		 535 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  38.03 
 
 		 530 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  37.48 
 
 		 526 aa  299  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  33.46 
 
 		 534 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  37.55 
 
 		 531 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  39.85 
 
 		 534 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  38.21 
 
 		 524 aa  283  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  31.89 
 
 		 530 aa  276  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  40.97 
 
 		 527 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  39.07 
 
 		 525 aa  274  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  34.35 
 
 		 529 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  36.55 
 
 		 545 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  37.76 
 
 		 531 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  32.77 
 
 		 528 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  38.03 
 
 		 533 aa  270  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  31.1 
 
 		 529 aa  262  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  30.81 
 
 		 529 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  30.52 
 
 		 529 aa  259  6e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  32.95 
 
 		 530 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  36.21 
 
 		 557 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 536 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  36.45 
 
 		 532 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  35.7 
 
 		 539 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  34.43 
 
 		 541 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.78 
 
 		 538 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  37.1 
 
 		 548 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  35.56 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  34.59 
 
 		 525 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  38.6 
 
 		 532 aa  231  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 		 524 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  37.52 
 
 		 546 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 		 548 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  35.81 
 
 		 551 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  35.81 
 
 		 551 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  33.65 
 
 		 553 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  37.15 
 
 		 550 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  36.95 
 
 		 546 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  33.52 
 
 		 525 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  39.93 
 
 		 534 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  28.04 
 
 		 639 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  28.03 
 
 		 580 aa  215  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.86 
 
 		 643 aa  213  7e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 545 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.33 
 
 		 555 aa  209  8e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  29.98 
 
 		 531 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  31.2 
 
 		 523 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  35.58 
 
 		 542 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  34.66 
 
 		 545 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  34.91 
 
 		 641 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.6 
 
 		 634 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  29.96 
 
 		 581 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.13 
 
 		 659 aa  203  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  29.96 
 
 		 658 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  31.89 
 
 		 552 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  32.21 
 
 		 645 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  29.85 
 
 		 644 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  31.55 
 
 		 540 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  31.55 
 
 		 540 aa  199  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  36.56 
 
 		 537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  29.85 
 
 		 662 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  29.67 
 
 		 658 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 		 658 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  31.55 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  29.67 
 
 		 640 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.82 
 
 		 690 aa  198  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 		 658 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 		 644 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 		 658 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  32.08 
 
 		 767 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  29.85 
 
 		 659 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  32.03 
 
 		 533 aa  197  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>