More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1995 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  100 
 
 
532 aa  1025    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  46.2 
 
 
551 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  46.2 
 
 
551 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  45.19 
 
 
548 aa  360  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.51 
 
 
548 aa  353  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  46.73 
 
 
546 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  47.31 
 
 
546 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.65 
 
 
536 aa  346  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  45.71 
 
 
550 aa  346  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  43.05 
 
 
539 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  47.55 
 
 
557 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 
548 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 
548 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 
548 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 
548 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 
548 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 
548 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.07 
 
 
548 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  45.75 
 
 
553 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  44.11 
 
 
541 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.23 
 
 
538 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  39.64 
 
 
530 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  37.74 
 
 
527 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  43.93 
 
 
535 aa  280  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  41.6 
 
 
525 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  39.07 
 
 
533 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  38.16 
 
 
526 aa  273  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  40.63 
 
 
525 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  37.91 
 
 
545 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  38.14 
 
 
535 aa  270  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  37.69 
 
 
530 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  31.03 
 
 
534 aa  267  4e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  39.39 
 
 
535 aa  266  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  39.14 
 
 
554 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  38.9 
 
 
525 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  36.54 
 
 
531 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  38.95 
 
 
549 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  35.55 
 
 
541 aa  256  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  38.33 
 
 
527 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  39.77 
 
 
537 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  39.77 
 
 
537 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  39.77 
 
 
537 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  36.61 
 
 
544 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  34.96 
 
 
541 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  34.72 
 
 
523 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  36.79 
 
 
534 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  35.87 
 
 
524 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  35.9 
 
 
558 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  36.91 
 
 
565 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  37.12 
 
 
536 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  33.86 
 
 
531 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  36.36 
 
 
531 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.98 
 
 
524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  31.09 
 
 
529 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  36.73 
 
 
553 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  38.65 
 
 
516 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  28.68 
 
 
528 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  36.94 
 
 
555 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  30.88 
 
 
530 aa  217  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  31.31 
 
 
519 aa  217  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  37.37 
 
 
520 aa  217  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  29.22 
 
 
529 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
530 aa  212  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  34.5 
 
 
531 aa  211  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  36.05 
 
 
532 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  28.09 
 
 
529 aa  207  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  34.92 
 
 
535 aa  206  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.06 
 
 
634 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  38.57 
 
 
534 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  32.5 
 
 
548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.4 
 
 
690 aa  201  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  33.15 
 
 
629 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  26.57 
 
 
529 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  34.82 
 
 
511 aa  197  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 
545 aa  196  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  32.35 
 
 
641 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  30.89 
 
 
709 aa  194  5e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  29.73 
 
 
644 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  29.6 
 
 
658 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  32.89 
 
 
641 aa  193  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.62 
 
 
641 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  32.97 
 
 
645 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  32.5 
 
 
627 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  31.09 
 
 
544 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 
637 aa  192  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  31.85 
 
 
554 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 
662 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  29.66 
 
 
658 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.27 
 
 
639 aa  192  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  31.13 
 
 
646 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  33.52 
 
 
649 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  29.66 
 
 
658 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  31.28 
 
 
637 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 
637 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  29.66 
 
 
658 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  29.85 
 
 
658 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 
637 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 
659 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 
637 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 
637 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>