More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4308 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 539 aa  1082    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.95 
 
 		 548 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  51.57 
 
 		 551 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  51.57 
 
 		 551 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  51.12 
 
 		 548 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  51.59 
 
 		 546 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  51.78 
 
 		 546 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  51.48 
 
 		 550 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  51.37 
 
 		 548 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.37 
 
 		 548 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.37 
 
 		 548 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.37 
 
 		 548 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  51.37 
 
 		 548 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  50.19 
 
 		 541 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.37 
 
 		 548 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  51.37 
 
 		 548 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  46 
 
 		 557 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.07 
 
 		 536 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  44.47 
 
 		 553 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.78 
 
 		 538 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  42.48 
 
 		 532 aa  341  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  39.81 
 
 		 530 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  42.66 
 
 		 525 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  42.66 
 
 		 525 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  38.87 
 
 		 535 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  40.3 
 
 		 535 aa  316  7e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  38.81 
 
 		 533 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  39.26 
 
 		 527 aa  313  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  39.04 
 
 		 541 aa  310  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  37.4 
 
 		 530 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  39.08 
 
 		 525 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  38.55 
 
 		 545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  37.4 
 
 		 531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 		 534 aa  302  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  35.8 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 		 544 aa  300  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 		 535 aa  299  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  38.62 
 
 		 534 aa  299  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  39.22 
 
 		 537 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  39.22 
 
 		 537 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  39.22 
 
 		 537 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  35.92 
 
 		 524 aa  293  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  37.31 
 
 		 531 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  35.74 
 
 		 526 aa  286  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  38.49 
 
 		 549 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 520 aa  280  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  36.07 
 
 		 531 aa  275  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  34.53 
 
 		 558 aa  273  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  37.71 
 
 		 536 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 554 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  38.16 
 
 		 527 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  37.29 
 
 		 565 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  35.62 
 
 		 532 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 		 524 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 535 aa  256  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  35.66 
 
 		 553 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  33.98 
 
 		 523 aa  251  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  33.14 
 
 		 531 aa  251  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  36.33 
 
 		 534 aa  250  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  35.22 
 
 		 530 aa  249  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 548 aa  246  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  36.64 
 
 		 516 aa  243  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  35.48 
 
 		 555 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  27.83 
 
 		 528 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  29.27 
 
 		 530 aa  239  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  28.06 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  29.64 
 
 		 529 aa  237  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  27.19 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  30.25 
 
 		 529 aa  230  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  31.57 
 
 		 519 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  34.92 
 
 		 545 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  31.78 
 
 		 626 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  33.03 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  29.82 
 
 		 581 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  33.52 
 
 		 511 aa  210  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  32.59 
 
 		 663 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  31.78 
 
 		 635 aa  208  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  33.63 
 
 		 542 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  34.02 
 
 		 632 aa  207  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.23 
 
 		 634 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  33.4 
 
 		 642 aa  207  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.65 
 
 		 644 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  33.02 
 
 		 636 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 636 aa  206  9e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  29.7 
 
 		 634 aa  206  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  33.2 
 
 		 641 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  31.42 
 
 		 639 aa  204  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.84 
 
 		 643 aa  204  4e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.64 
 
 		 636 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  32.52 
 
 		 629 aa  203  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  32.04 
 
 		 637 aa  203  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  31.91 
 
 		 637 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  31.91 
 
 		 637 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  33.27 
 
 		 545 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  31.25 
 
 		 640 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  32.11 
 
 		 634 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  33.2 
 
 		 635 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  30.14 
 
 		 639 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.07 
 
 		 641 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  33.2 
 
 		 649 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>