More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2939 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  71.69 
 
 
548 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  71.32 
 
 
548 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  89.64 
 
 
548 aa  948    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  89.82 
 
 
546 aa  912    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  72.23 
 
 
548 aa  723    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  71.69 
 
 
548 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  97.46 
 
 
551 aa  1002    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  90 
 
 
546 aa  909    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  97.46 
 
 
551 aa  1002    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  100 
 
 
550 aa  1082    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  71.69 
 
 
548 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  71.69 
 
 
548 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  71.69 
 
 
548 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  71.69 
 
 
548 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  55.01 
 
 
541 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  51.48 
 
 
539 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  46.54 
 
 
557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 
536 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  45.59 
 
 
553 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.37 
 
 
538 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  45.52 
 
 
532 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  40.15 
 
 
530 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  42.26 
 
 
525 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  41.3 
 
 
525 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  40.67 
 
 
535 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  36.65 
 
 
541 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 
544 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  37.98 
 
 
541 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  38.67 
 
 
535 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  38.29 
 
 
533 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  36.13 
 
 
527 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  39.55 
 
 
525 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  31.39 
 
 
534 aa  278  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  35.85 
 
 
526 aa  276  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  37.5 
 
 
535 aa  276  8e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  37.45 
 
 
545 aa  276  9e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  36.08 
 
 
531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  36.9 
 
 
524 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  38.92 
 
 
549 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  35.29 
 
 
530 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  35 
 
 
558 aa  266  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  37.34 
 
 
554 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  39.24 
 
 
537 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  35.46 
 
 
531 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  39.24 
 
 
537 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  39.24 
 
 
537 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.27 
 
 
531 aa  260  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  36.74 
 
 
532 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  38.55 
 
 
534 aa  259  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  37.41 
 
 
553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  37.2 
 
 
527 aa  250  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  28.18 
 
 
529 aa  249  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  37.22 
 
 
555 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  39.58 
 
 
534 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  32.36 
 
 
523 aa  237  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  35.44 
 
 
536 aa  236  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 
524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  28.68 
 
 
528 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  34.15 
 
 
548 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  36.52 
 
 
520 aa  229  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  37.34 
 
 
565 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  37.34 
 
 
516 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  33.64 
 
 
531 aa  226  7e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  34.13 
 
 
535 aa  226  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  29.77 
 
 
529 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  28.18 
 
 
530 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  27.47 
 
 
529 aa  224  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  28.33 
 
 
529 aa  213  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  34.81 
 
 
530 aa  212  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  30.66 
 
 
436 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  33.15 
 
 
649 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  32.79 
 
 
649 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.08 
 
 
634 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  32.24 
 
 
649 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  32.02 
 
 
648 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  31.96 
 
 
645 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  32.61 
 
 
661 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  32.61 
 
 
661 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  33.09 
 
 
649 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.01 
 
 
643 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  32.97 
 
 
688 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  27.99 
 
 
645 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  32.86 
 
 
642 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  33.45 
 
 
641 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  33.39 
 
 
648 aa  189  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.5 
 
 
634 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  34.59 
 
 
651 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  29.5 
 
 
519 aa  188  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 
660 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 
660 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  32.97 
 
 
648 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  32.97 
 
 
648 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  32.97 
 
 
648 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  32.97 
 
 
660 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  29.83 
 
 
636 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  31.37 
 
 
636 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  32.92 
 
 
641 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  33.08 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  32.53 
 
 
636 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  30.47 
 
 
637 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>