More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46010 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  90.33 
 
 		 557 aa  911    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  100 
 
 		 538 aa  1042    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.72 
 
 		 536 aa  535  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  55.97 
 
 		 553 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  52.54 
 
 		 530 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  53.15 
 
 		 525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  52.39 
 
 		 525 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  45.98 
 
 		 548 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  45.72 
 
 		 551 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  45.72 
 
 		 551 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  46.74 
 
 		 546 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  46.37 
 
 		 550 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  45.81 
 
 		 546 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 548 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  44.78 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  49.35 
 
 		 535 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  43.21 
 
 		 541 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  41.67 
 
 		 541 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  46.23 
 
 		 532 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  40.19 
 
 		 530 aa  319  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  40.84 
 
 		 525 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  39.81 
 
 		 531 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  38.21 
 
 		 558 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  38.45 
 
 		 541 aa  312  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  40.11 
 
 		 535 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  39.01 
 
 		 527 aa  310  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  41.32 
 
 		 537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  41.32 
 
 		 537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  41.32 
 
 		 537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  42.37 
 
 		 549 aa  302  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  38.27 
 
 		 524 aa  302  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  38.82 
 
 		 554 aa  299  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  39.7 
 
 		 544 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  39.92 
 
 		 531 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  39.46 
 
 		 533 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  39.09 
 
 		 536 aa  294  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  40 
 
 		 545 aa  293  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  36.78 
 
 		 526 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  39.39 
 
 		 527 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  38.87 
 
 		 535 aa  289  8e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  37.76 
 
 		 535 aa  289  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  41.29 
 
 		 534 aa  286  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  30.81 
 
 		 534 aa  279  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  35.62 
 
 		 531 aa  277  3e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.15 
 
 		 531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  36.87 
 
 		 523 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  37.55 
 
 		 553 aa  269  8.999999999999999e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  32.32 
 
 		 529 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  30.86 
 
 		 528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  40.58 
 
 		 534 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  38.86 
 
 		 530 aa  264  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  37.6 
 
 		 555 aa  264  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  30.9 
 
 		 529 aa  257  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  37.19 
 
 		 532 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 548 aa  253  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  37.86 
 
 		 565 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  29.9 
 
 		 529 aa  249  8e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 		 529 aa  249  9e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  29.89 
 
 		 530 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  38.33 
 
 		 516 aa  240  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  31.98 
 
 		 519 aa  223  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  34.47 
 
 		 511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  34.61 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  34.62 
 
 		 632 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  31.99 
 
 		 623 aa  189  8e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  34.95 
 
 		 553 aa  187  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.2 
 
 		 634 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  34.87 
 
 		 542 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  28.17 
 
 		 544 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  33.21 
 
 		 540 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  27.1 
 
 		 580 aa  182  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.08 
 
 		 643 aa  182  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  35.45 
 
 		 569 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  33.21 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  29.27 
 
 		 636 aa  181  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1085  ABC transporter related  28.22 
 
 		 534 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000470508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  31.74 
 
 		 649 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  29.5 
 
 		 641 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  27.91 
 
 		 634 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  32.5 
 
 		 540 aa  176  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  32.63 
 
 		 540 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.47 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.67 
 
 		 644 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  30.44 
 
 		 581 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  30.06 
 
 		 627 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.22 
 
 		 550 aa  174  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  30.25 
 
 		 640 aa  174  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 		 545 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  26.92 
 
 		 645 aa  174  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  35.28 
 
 		 537 aa  173  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  31.93 
 
 		 624 aa  173  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>