More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0806 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  87.43 
 
 
553 aa  929    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  72.38 
 
 
554 aa  736    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  68.71 
 
 
555 aa  717    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  68.01 
 
 
544 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  62.68 
 
 
545 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  73.37 
 
 
553 aa  773    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  64.59 
 
 
542 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  72.81 
 
 
550 aa  762    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  100 
 
 
569 aa  1132    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  73.37 
 
 
553 aa  773    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  75.45 
 
 
550 aa  812    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  61.4 
 
 
545 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  73.37 
 
 
553 aa  773    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  75.55 
 
 
548 aa  776    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  63.05 
 
 
544 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  61.13 
 
 
549 aa  571  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0053  ABC transporter related protein  61.31 
 
 
548 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00894848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  54.23 
 
 
551 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  56.23 
 
 
537 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  52.35 
 
 
537 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  40.62 
 
 
543 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  33.65 
 
 
634 aa  266  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  33.7 
 
 
552 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  35.98 
 
 
567 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  34.35 
 
 
564 aa  257  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  34.17 
 
 
581 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.08 
 
 
540 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.03 
 
 
575 aa  250  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.65 
 
 
548 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.98 
 
 
548 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.8 
 
 
548 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  33.39 
 
 
636 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.72 
 
 
668 aa  248  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  35.85 
 
 
649 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  33.46 
 
 
540 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  35.85 
 
 
649 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  34.23 
 
 
564 aa  245  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  33.27 
 
 
540 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.65 
 
 
540 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.27 
 
 
709 aa  244  3.9999999999999997e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.05 
 
 
579 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 
554 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  34.08 
 
 
560 aa  243  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  34.4 
 
 
545 aa  243  9e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  34.75 
 
 
659 aa  242  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  32.53 
 
 
540 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  35.04 
 
 
574 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 
555 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  32.28 
 
 
540 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  36.26 
 
 
569 aa  239  9e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  36.21 
 
 
649 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 
648 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  32.65 
 
 
540 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 
545 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  35.66 
 
 
688 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  30.64 
 
 
517 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.53 
 
 
555 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  30.89 
 
 
530 aa  238  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  32.24 
 
 
879 aa  238  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  30.02 
 
 
517 aa  237  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  30.89 
 
 
517 aa  237  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.53 
 
 
555 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  36.02 
 
 
661 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 
660 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 
660 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  36.02 
 
 
661 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  35.14 
 
 
641 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  32.46 
 
 
540 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.1 
 
 
672 aa  237  5.0000000000000005e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  33.9 
 
 
540 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.53 
 
 
555 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.58 
 
 
554 aa  236  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
660 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
648 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
648 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5556  ABC transporter, ATP-binding protein  30.7 
 
 
517 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
648 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5614  ABC transporter ATP-binding protein uup  30.7 
 
 
517 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  30.51 
 
 
517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  30.51 
 
 
517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  30.51 
 
 
517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  34.09 
 
 
632 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  31.41 
 
 
543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  33.46 
 
 
540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  30.51 
 
 
517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.83 
 
 
645 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  31.4 
 
 
545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  32.89 
 
 
540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  30.51 
 
 
517 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  31.19 
 
 
630 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  31.59 
 
 
544 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  35.65 
 
 
648 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  33.88 
 
 
626 aa  234  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.67 
 
 
555 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  32.77 
 
 
658 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  30.96 
 
 
543 aa  233  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.34 
 
 
555 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0447  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.47 
 
 
570 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46914  normal  0.303037 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  34.86 
 
 
1065 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3519  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.24 
 
 
553 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.876019  normal  0.0625802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>