More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3420 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  100 
 
 		 554 aa  1097    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  69.8 
 
 		 553 aa  734    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  79.75 
 
 		 553 aa  836    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  74.37 
 
 		 550 aa  803    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  63.35 
 
 		 555 aa  648    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  79.75 
 
 		 550 aa  842    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  79.75 
 
 		 553 aa  836    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  72.38 
 
 		 569 aa  758    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  79.75 
 
 		 553 aa  836    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  78.66 
 
 		 548 aa  811    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  60.58 
 
 		 545 aa  620  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  61.44 
 
 		 542 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  58.95 
 
 		 545 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  62.03 
 
 		 544 aa  601  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  61.66 
 
 		 544 aa  558  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  59.14 
 
 		 549 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0053  ABC transporter related protein  58.95 
 
 		 548 aa  526  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  54.12 
 
 		 537 aa  481  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  52.32 
 
 		 551 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  51.11 
 
 		 537 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  40.47 
 
 		 543 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  30.02 
 
 		 639 aa  258  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  35.79 
 
 		 648 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 		 660 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 		 660 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 		 648 aa  250  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  35.32 
 
 		 641 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 648 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 648 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 660 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 648 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.97 
 
 		 709 aa  248  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  36.23 
 
 		 649 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  35.26 
 
 		 649 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  31.13 
 
 		 634 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.38 
 
 		 645 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  35.32 
 
 		 649 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  33.27 
 
 		 581 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 545 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 1065 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  32.19 
 
 		 543 aa  244  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.47 
 
 		 641 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  32.74 
 
 		 636 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32 
 
 		 668 aa  243  7e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  33.27 
 
 		 544 aa  243  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  35.07 
 
 		 688 aa  243  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  35.32 
 
 		 661 aa  243  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  35.32 
 
 		 661 aa  243  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  37.27 
 
 		 535 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  32.11 
 
 		 575 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  33.33 
 
 		 659 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  31.85 
 
 		 540 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  35.13 
 
 		 649 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.58 
 
 		 644 aa  241  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  31.71 
 
 		 552 aa  240  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  34.03 
 
 		 548 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  34.48 
 
 		 541 aa  240  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  32.62 
 
 		 540 aa  239  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  33.72 
 
 		 567 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.55 
 
 		 549 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  32.07 
 
 		 543 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  32.98 
 
 		 540 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  31.7 
 
 		 542 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  33.27 
 
 		 548 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  33.27 
 
 		 548 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  32.39 
 
 		 540 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  37.76 
 
 		 536 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  32.2 
 
 		 540 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  32.2 
 
 		 540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  30.39 
 
 		 659 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  35.54 
 
 		 642 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  36.12 
 
 		 544 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 		 662 aa  233  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  32.89 
 
 		 564 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  32.78 
 
 		 540 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 632 aa  233  7.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 		 644 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.94 
 
 		 672 aa  233  9e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 		 658 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 		 658 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  30.43 
 
 		 630 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  33.15 
 
 		 640 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  32.71 
 
 		 540 aa  232  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.2 
 
 		 658 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  36.56 
 
 		 541 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.2 
 
 		 640 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 		 658 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  33.27 
 
 		 626 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  30.51 
 
 		 659 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  30.51 
 
 		 644 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  28.68 
 
 		 540 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.7 
 
 		 643 aa  230  6e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  30.77 
 
 		 547 aa  229  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30.65 
 
 		 636 aa  229  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  31.33 
 
 		 545 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  32.5 
 
 		 564 aa  228  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.88 
 
 		 690 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  35.63 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  29.91 
 
 		 666 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  31.73 
 
 		 540 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>