More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3350 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  100 
 
 
547 aa  1105    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  40.85 
 
 
536 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  38.01 
 
 
546 aa  353  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  37.38 
 
 
537 aa  331  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  36.3 
 
 
636 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  39.49 
 
 
551 aa  322  9.000000000000001e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  37.5 
 
 
563 aa  319  7.999999999999999e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  34.27 
 
 
552 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  40.15 
 
 
551 aa  313  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  35.09 
 
 
640 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  36.25 
 
 
659 aa  309  8e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  33.76 
 
 
549 aa  309  9e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  36.89 
 
 
644 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  34 
 
 
540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  33.83 
 
 
634 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
545 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  34.12 
 
 
544 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  34 
 
 
540 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  34.66 
 
 
542 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  31.37 
 
 
666 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.88 
 
 
543 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  37.43 
 
 
641 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  36.53 
 
 
563 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  33.09 
 
 
543 aa  299  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.31 
 
 
709 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  33.27 
 
 
634 aa  296  6e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.97 
 
 
690 aa  296  8e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.93 
 
 
668 aa  293  5e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  34.62 
 
 
545 aa  293  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  33.58 
 
 
672 aa  291  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  34.84 
 
 
659 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  32.16 
 
 
643 aa  290  4e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  35.16 
 
 
620 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  33.83 
 
 
540 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  34.07 
 
 
630 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  33.52 
 
 
635 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  33.88 
 
 
659 aa  286  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  35.14 
 
 
632 aa  286  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  33.63 
 
 
645 aa  286  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  36.25 
 
 
550 aa  286  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
540 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  33.58 
 
 
548 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  32.17 
 
 
540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  32.6 
 
 
644 aa  283  6.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  33.09 
 
 
636 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  33.39 
 
 
548 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.33 
 
 
583 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  33.39 
 
 
548 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  32.22 
 
 
540 aa  281  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  32.66 
 
 
642 aa  280  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  33.15 
 
 
540 aa  280  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  32.66 
 
 
642 aa  280  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  34.32 
 
 
539 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  33.33 
 
 
658 aa  279  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  32.41 
 
 
540 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  29.86 
 
 
627 aa  278  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  30.24 
 
 
641 aa  277  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 
644 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  32.72 
 
 
645 aa  277  3e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  33.58 
 
 
540 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 
659 aa  276  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 
644 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  32.35 
 
 
545 aa  276  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.23 
 
 
639 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  32.04 
 
 
540 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  33.15 
 
 
658 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 
658 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 
658 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  33.15 
 
 
640 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  33.09 
 
 
540 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 
658 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 
662 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  32.01 
 
 
560 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  32.55 
 
 
649 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  32.65 
 
 
540 aa  274  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  33.52 
 
 
657 aa  274  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  32.96 
 
 
540 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  31.85 
 
 
540 aa  273  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  32.55 
 
 
565 aa  272  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0217  ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 
626 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 
626 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0929  ABC transporter related  36.08 
 
 
714 aa  272  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.526225  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 
626 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0238  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 
626 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
518 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  30.13 
 
 
630 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  31.8 
 
 
638 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  32.47 
 
 
540 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  28.6 
 
 
518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 
626 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  33.64 
 
 
767 aa  270  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  32.84 
 
 
540 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0205  ABC transporter related  34.43 
 
 
628 aa  269  8e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  32.5 
 
 
649 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  32.47 
 
 
540 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.37 
 
 
541 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  33.09 
 
 
645 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0362  ABC transporter related  30.04 
 
 
517 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0008233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5082  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 
626 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0119916  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  33.39 
 
 
638 aa  267  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>