More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2588 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  100 
 
 		 563 aa  1092    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  59.29 
 
 		 537 aa  578  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  53.2 
 
 		 603 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  53.24 
 
 		 583 aa  481  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  55 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  50 
 
 		 563 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  46.93 
 
 		 536 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  46.35 
 
 		 585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  44.8 
 
 		 564 aa  330  3e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  36.53 
 
 		 547 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  40.14 
 
 		 546 aa  303  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  44.25 
 
 		 551 aa  288  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  37.75 
 
 		 563 aa  286  5e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 550 aa  279  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 562 aa  277  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  40.52 
 
 		 548 aa  268  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  40.29 
 
 		 552 aa  266  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 551 aa  261  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.71 
 
 		 600 aa  256  9e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  38.16 
 
 		 566 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.69 
 
 		 548 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.46 
 
 		 643 aa  241  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  37.48 
 
 		 553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  37.11 
 
 		 542 aa  233  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 545 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.35 
 
 		 550 aa  228  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  37.1 
 
 		 545 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  37.11 
 
 		 553 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  37.11 
 
 		 553 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  37.11 
 
 		 553 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  38.31 
 
 		 548 aa  226  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  34.33 
 
 		 554 aa  226  8e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3988  ABC transporter, ATPase subunit  32.4 
 
 		 533 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  31.91 
 
 		 552 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  31.68 
 
 		 549 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  30.43 
 
 		 653 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4100  ABC transporter-related protein  32.21 
 
 		 533 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.63 
 
 		 644 aa  223  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  36.96 
 
 		 550 aa  223  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  37.57 
 
 		 569 aa  223  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.68 
 
 		 659 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4130  ABC transporter related  32.59 
 
 		 533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  35.7 
 
 		 551 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.78 
 
 		 644 aa  221  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  31.5 
 
 		 658 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  29.25 
 
 		 634 aa  219  8.999999999999998e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  30.65 
 
 		 641 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.83 
 
 		 636 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  29.7 
 
 		 639 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  33.83 
 
 		 626 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0433  ABC transporter related  31.7 
 
 		 532 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.893812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.84 
 
 		 509 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.047738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  30.76 
 
 		 545 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21470  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  30.59 
 
 		 529 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  31.11 
 
 		 620 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  28.01 
 
 		 642 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  28.01 
 
 		 642 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.14 
 
 		 644 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 644 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.14 
 
 		 658 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.14 
 
 		 658 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.14 
 
 		 658 aa  213  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.14 
 
 		 658 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.14 
 
 		 640 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.14 
 
 		 659 aa  213  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  32.12 
 
 		 672 aa  213  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.87 
 
 		 659 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.14 
 
 		 662 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  29.95 
 
 		 640 aa  213  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  32.44 
 
 		 554 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  27.41 
 
 		 523 aa  212  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  28.08 
 
 		 515 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  30.02 
 
 		 646 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  28.14 
 
 		 515 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.62 
 
 		 555 aa  210  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  29.86 
 
 		 879 aa  209  9e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  29.42 
 
 		 642 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.84 
 
 		 690 aa  209  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  30.55 
 
 		 543 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  32.56 
 
 		 554 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  28.52 
 
 		 642 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  35.59 
 
 		 672 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  29.18 
 
 		 642 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  35.69 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  32.02 
 
 		 631 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  30.52 
 
 		 544 aa  208  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  29.7 
 
 		 540 aa  208  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  29.7 
 
 		 540 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 		 636 aa  207  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  30.51 
 
 		 630 aa  207  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  29.7 
 
 		 540 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  29.11 
 
 		 685 aa  206  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  30.83 
 
 		 542 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  29.53 
 
 		 620 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  30.92 
 
 		 540 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  29.49 
 
 		 575 aa  205  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  28.28 
 
 		 621 aa  205  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  28.7 
 
 		 645 aa  204  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  35.67 
 
 		 554 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.07 
 
 		 557 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>