More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01180 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 583 aa  1142    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  52.71 
 
 		 537 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  55.66 
 
 		 563 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  54.34 
 
 		 561 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  49.67 
 
 		 603 aa  445  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  45.22 
 
 		 585 aa  348  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  41.06 
 
 		 564 aa  323  8e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  45.16 
 
 		 563 aa  310  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  41.65 
 
 		 536 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  35.77 
 
 		 547 aa  303  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  39.3 
 
 		 562 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  37.03 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  39.58 
 
 		 552 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  36.84 
 
 		 563 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  37.88 
 
 		 553 aa  263  4.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  39.12 
 
 		 551 aa  263  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  40.93 
 
 		 551 aa  251  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  39.22 
 
 		 550 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  35.41 
 
 		 548 aa  246  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.38 
 
 		 509 aa  226  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.047738  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.06 
 
 		 548 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 644 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.24 
 
 		 637 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.72 
 
 		 635 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  30.88 
 
 		 659 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 662 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 644 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.6 
 
 		 635 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.01 
 
 		 639 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 637 aa  221  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  35.27 
 
 		 672 aa  221  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  29.68 
 
 		 641 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  32.55 
 
 		 637 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  32.55 
 
 		 637 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  32.55 
 
 		 637 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  30 
 
 		 658 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 637 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 658 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 637 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 637 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  30 
 
 		 640 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 637 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 637 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 658 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 658 aa  220  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.63 
 
 		 600 aa  220  6e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.84 
 
 		 635 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  33.16 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 659 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.52 
 
 		 636 aa  219  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.94 
 
 		 555 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.18 
 
 		 550 aa  218  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  29.82 
 
 		 658 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.66 
 
 		 635 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.66 
 
 		 635 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.66 
 
 		 635 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.66 
 
 		 635 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  31.69 
 
 		 545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.15 
 
 		 640 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.15 
 
 		 640 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.15 
 
 		 640 aa  212  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.48 
 
 		 634 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  33.03 
 
 		 637 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  33.03 
 
 		 637 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  33.03 
 
 		 637 aa  212  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.39 
 
 		 643 aa  211  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  30.77 
 
 		 540 aa  211  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  32.25 
 
 		 648 aa  210  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  36.3 
 
 		 554 aa  210  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  32.19 
 
 		 656 aa  210  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  28.5 
 
 		 644 aa  210  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  30.96 
 
 		 659 aa  210  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  29.24 
 
 		 523 aa  210  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  32.85 
 
 		 637 aa  209  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.36 
 
 		 637 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  35.17 
 
 		 545 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  35.02 
 
 		 553 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  35.57 
 
 		 540 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  35.02 
 
 		 553 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  35.59 
 
 		 569 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  35.02 
 
 		 553 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  31.04 
 
 		 540 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  30.89 
 
 		 544 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  30.39 
 
 		 543 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  32.48 
 
 		 636 aa  207  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 		 638 aa  207  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.85 
 
 		 634 aa  206  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  34.4 
 
 		 537 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  35.23 
 
 		 550 aa  203  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  30.62 
 
 		 639 aa  203  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  31.74 
 
 		 657 aa  203  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  29.86 
 
 		 543 aa  203  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  29.96 
 
 		 557 aa  203  8e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  30.18 
 
 		 653 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  32.3 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  32.3 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  32.3 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  32.12 
 
 		 636 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  33.27 
 
 		 642 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>