More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1283 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  100 
 
 		 551 aa  1062    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  55.04 
 
 		 536 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  47.54 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  46 
 
 		 537 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  40.15 
 
 		 547 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  44.95 
 
 		 563 aa  363  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  49.26 
 
 		 550 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  46.01 
 
 		 551 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 563 aa  330  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  46.31 
 
 		 561 aa  316  6e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  42.38 
 
 		 603 aa  299  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  40.26 
 
 		 585 aa  270  5.9999999999999995e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  40.28 
 
 		 564 aa  262  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  31.27 
 
 		 638 aa  262  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.92 
 
 		 644 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  30.4 
 
 		 645 aa  256  6e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  32.65 
 
 		 672 aa  254  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  30.97 
 
 		 659 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  29.74 
 
 		 634 aa  252  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  32.28 
 
 		 636 aa  251  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  35.81 
 
 		 620 aa  248  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.93 
 
 		 636 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  42.89 
 
 		 583 aa  246  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.19 
 
 		 641 aa  246  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 540 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  34.02 
 
 		 540 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  43.63 
 
 		 563 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  29.66 
 
 		 642 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  29.66 
 
 		 642 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  33.88 
 
 		 544 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  29.72 
 
 		 635 aa  240  4e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  29.98 
 
 		 658 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  40 
 
 		 562 aa  240  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.58 
 
 		 543 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 		 644 aa  239  9e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.95 
 
 		 643 aa  237  4e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  30.89 
 
 		 641 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  32.28 
 
 		 552 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  30.77 
 
 		 639 aa  236  9e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.14 
 
 		 690 aa  236  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  30.02 
 
 		 644 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  26.84 
 
 		 536 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.41 
 
 		 634 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  29.07 
 
 		 666 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  29.98 
 
 		 658 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  29.8 
 
 		 659 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  32.54 
 
 		 542 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  39.7 
 
 		 566 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  30.02 
 
 		 644 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.02 
 
 		 668 aa  233  5e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  29.8 
 
 		 658 aa  233  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  31.1 
 
 		 638 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  29.62 
 
 		 658 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  31.48 
 
 		 640 aa  233  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  29.98 
 
 		 662 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  29.8 
 
 		 658 aa  233  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  29.65 
 
 		 640 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  26.45 
 
 		 541 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  33.58 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  27.76 
 
 		 627 aa  231  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.11 
 
 		 549 aa  229  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  26.33 
 
 		 541 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  29.29 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  34.75 
 
 		 658 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  32.7 
 
 		 767 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  33.09 
 
 		 543 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 		 645 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.15 
 
 		 709 aa  228  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  29.29 
 
 		 515 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  33.77 
 
 		 659 aa  227  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  31.19 
 
 		 575 aa  227  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  33.4 
 
 		 540 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.27 
 
 		 557 aa  226  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  32.61 
 
 		 645 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  29.27 
 
 		 630 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.08 
 
 		 557 aa  224  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 		 663 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  28.42 
 
 		 639 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  28.62 
 
 		 685 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  28.04 
 
 		 540 aa  223  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  35.02 
 
 		 632 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  29.31 
 
 		 663 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  34.57 
 
 		 641 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.91 
 
 		 600 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  32.45 
 
 		 649 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  30.43 
 
 		 664 aa  221  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  31.68 
 
 		 536 aa  220  3.9999999999999997e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  31.94 
 
 		 638 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.7 
 
 		 636 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  33.77 
 
 		 659 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  33.27 
 
 		 649 aa  220  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.92 
 
 		 645 aa  219  7e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  28.52 
 
 		 641 aa  219  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  31.83 
 
 		 653 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  37.45 
 
 		 657 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.78 
 
 		 560 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0433  ABC transporter related  31.94 
 
 		 532 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.893812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  29.07 
 
 		 639 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>