More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0750 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  100 
 
 		 537 aa  1061    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  59.29 
 
 		 563 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  51.85 
 
 		 603 aa  485  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  50.09 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  55.97 
 
 		 583 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  50.09 
 
 		 536 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  45.64 
 
 		 564 aa  361  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  48.79 
 
 		 563 aa  353  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  44.94 
 
 		 585 aa  346  7e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 546 aa  341  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  41.4 
 
 		 563 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  37.38 
 
 		 547 aa  320  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  46.51 
 
 		 551 aa  319  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  42.96 
 
 		 551 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  42.88 
 
 		 550 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  39.12 
 
 		 548 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 566 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  41 
 
 		 562 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.57 
 
 		 600 aa  261  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  39.14 
 
 		 552 aa  260  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.23 
 
 		 548 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  33.71 
 
 		 653 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.76 
 
 		 644 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  30.45 
 
 		 523 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  33.83 
 
 		 641 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  32.35 
 
 		 659 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4364  ABC transporter related  31.75 
 
 		 519 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.11 
 
 		 634 aa  239  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  32.83 
 
 		 636 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  40.39 
 
 		 540 aa  237  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  35.47 
 
 		 554 aa  237  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  33.99 
 
 		 554 aa  237  5.0000000000000005e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.68 
 
 		 643 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 		 515 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  37.01 
 
 		 553 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.89 
 
 		 550 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  33.77 
 
 		 554 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.32 
 
 		 558 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  33.77 
 
 		 634 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1442  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 		 559 aa  233  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.465539  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  34.21 
 
 		 649 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.02 
 
 		 558 aa  233  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  32.71 
 
 		 632 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4130  ABC transporter related  32.51 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  34.7 
 
 		 556 aa  232  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3988  ABC transporter, ATPase subunit  32.01 
 
 		 533 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  32.89 
 
 		 557 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  33.03 
 
 		 633 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4100  ABC transporter-related protein  32.14 
 
 		 533 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  38.09 
 
 		 541 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  31.79 
 
 		 879 aa  230  6e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  33.03 
 
 		 632 aa  229  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1816  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.48 
 
 		 559 aa  229  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.461866  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.03 
 
 		 549 aa  229  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0433  ABC transporter related  31.11 
 
 		 532 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.893812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  36.98 
 
 		 672 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.74 
 
 		 668 aa  229  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.58 
 
 		 636 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.8 
 
 		 559 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 		 545 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  36.8 
 
 		 553 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  36.8 
 
 		 553 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.62 
 
 		 509 aa  228  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.047738  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  36.8 
 
 		 553 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  32.15 
 
 		 543 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 560 aa  226  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.03 
 
 		 558 aa  226  7e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 		 547 aa  226  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.27 
 
 		 560 aa  226  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.72 
 
 		 556 aa  226  9e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3426  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 554 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  33.33 
 
 		 631 aa  226  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  36.16 
 
 		 651 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  30.35 
 
 		 620 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  38.06 
 
 		 624 aa  225  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  31.41 
 
 		 540 aa  225  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 		 559 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  31.6 
 
 		 540 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  29.61 
 
 		 515 aa  225  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30.61 
 
 		 636 aa  224  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  34.46 
 
 		 641 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.91 
 
 		 554 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  31.89 
 
 		 642 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.73 
 
 		 556 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  33.33 
 
 		 649 aa  224  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 		 557 aa  224  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 659 aa  224  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.76 
 
 		 558 aa  224  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  31.47 
 
 		 644 aa  224  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1384  ABC transporter related protein  32.33 
 
 		 557 aa  224  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.66 
 
 		 658 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.66 
 
 		 658 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.66 
 
 		 658 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  34.88 
 
 		 545 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.56 
 
 		 672 aa  223  4.9999999999999996e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.66 
 
 		 658 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  31.47 
 
 		 658 aa  223  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 		 559 aa  223  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 652 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.51 
 
 		 557 aa  223  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>