More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4837 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  100 
 
 		 551 aa  1078    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  66.48 
 
 		 550 aa  609  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  55.02 
 
 		 546 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  54.17 
 
 		 536 aa  485  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  44.53 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  39.31 
 
 		 547 aa  359  6e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  42.8 
 
 		 537 aa  342  8e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  46.18 
 
 		 551 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  41.14 
 
 		 563 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.23 
 
 		 634 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  32.91 
 
 		 636 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  39.01 
 
 		 583 aa  252  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.54 
 
 		 668 aa  252  1e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  34.49 
 
 		 659 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.34 
 
 		 634 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  31.95 
 
 		 552 aa  243  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  37.25 
 
 		 603 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  37.25 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  37.94 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  37.25 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  37.25 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.99 
 
 		 659 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.33 
 
 		 532 aa  239  9e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  32.48 
 
 		 640 aa  239  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.24 
 
 		 709 aa  237  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  38.74 
 
 		 552 aa  238  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  37.27 
 
 		 545 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30.61 
 
 		 636 aa  236  9e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 644 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  36.26 
 
 		 632 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 658 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 658 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  38.07 
 
 		 561 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 		 545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.32 
 
 		 659 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  31.44 
 
 		 644 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 		 658 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 		 640 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 658 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  37.99 
 
 		 569 aa  233  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.35 
 
 		 690 aa  233  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 562 aa  233  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  34.96 
 
 		 659 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.18 
 
 		 555 aa  233  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2238  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000471653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.67 
 
 		 636 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  31.08 
 
 		 643 aa  232  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  30.71 
 
 		 658 aa  231  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  32.71 
 
 		 767 aa  231  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  30.22 
 
 		 638 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  34.02 
 
 		 537 aa  230  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.61 
 
 		 643 aa  230  4e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  31.08 
 
 		 643 aa  229  8e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.15 
 
 		 600 aa  229  9e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  32.97 
 
 		 658 aa  229  9e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  28.73 
 
 		 642 aa  229  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  28.73 
 
 		 642 aa  229  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5134  ABC transporter related  34.74 
 
 		 542 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  35.67 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.28 
 
 		 585 aa  228  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  28.57 
 
 		 535 aa  226  6e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  28.31 
 
 		 639 aa  226  6e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  30.71 
 
 		 672 aa  226  8e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.94 
 
 		 644 aa  226  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  32.69 
 
 		 620 aa  226  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.38 
 
 		 550 aa  225  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 553 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.1 
 
 		 550 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  29.7 
 
 		 639 aa  224  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  29.96 
 
 		 638 aa  225  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  29.62 
 
 		 644 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  30.21 
 
 		 632 aa  224  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 		 548 aa  224  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  36.9 
 
 		 550 aa  224  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  36.83 
 
 		 554 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  29.21 
 
 		 666 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  30.51 
 
 		 630 aa  223  4.9999999999999996e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 548 aa  223  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.08 
 
 		 560 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  28.57 
 
 		 630 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  30.62 
 
 		 564 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  34.21 
 
 		 542 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  29.78 
 
 		 641 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  28.95 
 
 		 645 aa  222  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  29.91 
 
 		 641 aa  221  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.65 
 
 		 560 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 566 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  29.93 
 
 		 549 aa  220  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  34.46 
 
 		 653 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  34.79 
 
 		 556 aa  219  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  30.13 
 
 		 635 aa  219  8.999999999999998e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  36.87 
 
 		 544 aa  219  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2802  ABC transporter related protein  33.77 
 
 		 532 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15491  normal  0.0601311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  29.94 
 
 		 646 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  33.39 
 
 		 545 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.41 
 
 		 561 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 		 560 aa  219  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  29.7 
 
 		 581 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  35.24 
 
 		 563 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>