More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4107 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  100 
 
 		 550 aa  1060    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  66.48 
 
 		 551 aa  637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  56.69 
 
 		 546 aa  532  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  56.85 
 
 		 536 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  45.32 
 
 		 563 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  42.88 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  36 
 
 		 547 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  49.35 
 
 		 551 aa  323  5e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 563 aa  300  7e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  40.81 
 
 		 561 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  31.17 
 
 		 634 aa  276  7e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  39.57 
 
 		 603 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.52 
 
 		 634 aa  269  8e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  31.4 
 
 		 645 aa  269  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  30.65 
 
 		 636 aa  263  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  33.03 
 
 		 641 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  33.03 
 
 		 636 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  32.96 
 
 		 552 aa  263  8e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  30.41 
 
 		 642 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  30.41 
 
 		 642 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.81 
 
 		 662 aa  260  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.88 
 
 		 659 aa  259  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  31.08 
 
 		 644 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.14 
 
 		 644 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.81 
 
 		 644 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.49 
 
 		 583 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.77 
 
 		 658 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 		 659 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 658 aa  258  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 		 640 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 		 658 aa  257  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 658 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  38.55 
 
 		 657 aa  257  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.95 
 
 		 564 aa  256  9e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  30.71 
 
 		 658 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  39.58 
 
 		 562 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.28 
 
 		 585 aa  254  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.68 
 
 		 644 aa  252  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  37.13 
 
 		 632 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  29.73 
 
 		 666 aa  249  7e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  30.09 
 
 		 641 aa  246  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.43 
 
 		 668 aa  246  6e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.93 
 
 		 643 aa  246  6.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  40.18 
 
 		 552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.03 
 
 		 532 aa  244  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  28.71 
 
 		 630 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.61 
 
 		 709 aa  243  6e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.74 
 
 		 690 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  32.23 
 
 		 672 aa  241  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  30.46 
 
 		 638 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 		 636 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  30.46 
 
 		 581 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.06 
 
 		 639 aa  239  9e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  31.97 
 
 		 540 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  32.49 
 
 		 659 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  31.08 
 
 		 639 aa  239  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  32.26 
 
 		 649 aa  238  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  31.44 
 
 		 549 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.8 
 
 		 550 aa  237  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  32.29 
 
 		 540 aa  236  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  32.23 
 
 		 540 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  31.02 
 
 		 640 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  26.89 
 
 		 541 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  35.33 
 
 		 545 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  35.3 
 
 		 545 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  32.05 
 
 		 540 aa  233  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.89 
 
 		 560 aa  233  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  31.99 
 
 		 536 aa  233  8.000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  38.41 
 
 		 553 aa  233  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0365  ABC transporter related  29.1 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  31.08 
 
 		 638 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  30.19 
 
 		 564 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.2 
 
 		 548 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  33.58 
 
 		 548 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  26.33 
 
 		 541 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  32.22 
 
 		 540 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  32.85 
 
 		 659 aa  230  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  30.57 
 
 		 575 aa  230  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  28.16 
 
 		 515 aa  230  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 		 545 aa  229  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  32.33 
 
 		 537 aa  229  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  30.32 
 
 		 643 aa  229  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  33.58 
 
 		 548 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  30.89 
 
 		 540 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  36.29 
 
 		 556 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  28.65 
 
 		 627 aa  228  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  30.32 
 
 		 643 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  30.94 
 
 		 564 aa  228  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 658 aa  227  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  30.89 
 
 		 645 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  25.55 
 
 		 536 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  31.93 
 
 		 539 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  29.77 
 
 		 635 aa  228  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  29.57 
 
 		 514 aa  227  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  30.89 
 
 		 540 aa  227  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  32.84 
 
 		 540 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.77 
 
 		 561 aa  227  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0358  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 514 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  30.93 
 
 		 545 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 548 aa  226  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>