More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1328 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  100 
 
 
553 aa  1065    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  63.14 
 
 
552 aa  616  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  64.85 
 
 
548 aa  615  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  54.76 
 
 
554 aa  559  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  49.63 
 
 
562 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1063  ABC transporter related protein  61.81 
 
 
671 aa  388  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  45.8 
 
 
548 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  45.84 
 
 
566 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  46.59 
 
 
540 aa  333  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  41.37 
 
 
600 aa  322  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.7 
 
 
509 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.047738  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.7 
 
 
583 aa  238  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  37.2 
 
 
537 aa  238  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  38.12 
 
 
561 aa  226  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37 
 
 
564 aa  225  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  38.46 
 
 
536 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  36.24 
 
 
603 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  37.48 
 
 
563 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.57 
 
 
585 aa  217  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  35.01 
 
 
546 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  37.17 
 
 
551 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  30.22 
 
 
547 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  35.2 
 
 
563 aa  196  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  37.05 
 
 
550 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  35.2 
 
 
537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  35.56 
 
 
554 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  37.59 
 
 
543 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.78 
 
 
555 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  33.45 
 
 
542 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  29.08 
 
 
634 aa  178  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  29.66 
 
 
723 aa  177  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.97 
 
 
550 aa  177  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  27.77 
 
 
636 aa  177  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.2 
 
 
635 aa  176  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.24 
 
 
635 aa  176  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.83 
 
 
637 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  27.03 
 
 
642 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  29.82 
 
 
530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  31.34 
 
 
648 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.27 
 
 
555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  31.95 
 
 
545 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  29 
 
 
558 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  33.09 
 
 
553 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  33.09 
 
 
553 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  33.09 
 
 
553 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.62 
 
 
635 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 
635 aa  173  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  33.02 
 
 
631 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.1 
 
 
637 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.28 
 
 
637 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  28.28 
 
 
637 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  28.28 
 
 
637 aa  172  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 
635 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.33 
 
 
640 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 
635 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.28 
 
 
637 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  28.28 
 
 
637 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.28 
 
 
637 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.33 
 
 
640 aa  172  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.28 
 
 
637 aa  172  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.28 
 
 
637 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  34.95 
 
 
550 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21470  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  29.55 
 
 
529 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 
635 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  31.12 
 
 
537 aa  171  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.33 
 
 
640 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3519  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.45 
 
 
553 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.876019  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.55 
 
 
554 aa  171  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  28.73 
 
 
638 aa  170  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  29.43 
 
 
633 aa  170  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  27.21 
 
 
535 aa  169  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  34.3 
 
 
548 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  28.2 
 
 
642 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  29.7 
 
 
632 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.93 
 
 
639 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  28.73 
 
 
627 aa  169  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3681  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.25 
 
 
553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  26.76 
 
 
548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  28.2 
 
 
642 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.1 
 
 
551 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.1 
 
 
551 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  27.03 
 
 
543 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  29.72 
 
 
533 aa  167  6.9999999999999995e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.4 
 
 
558 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.88 
 
 
532 aa  166  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.22 
 
 
559 aa  166  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  29.22 
 
 
668 aa  166  8e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  28.94 
 
 
627 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04409  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.09 
 
 
553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2203  ABC transporter related  30.88 
 
 
669 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.73 
 
 
555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  27.67 
 
 
636 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  30.02 
 
 
534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.71 
 
 
578 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.31 
 
 
556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  32.13 
 
 
606 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.03 
 
 
551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.13 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  25.28 
 
 
606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  28.94 
 
 
640 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>