More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2931 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  100 
 
 
561 aa  1079    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  53.47 
 
 
583 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  55.12 
 
 
563 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  51.53 
 
 
537 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  45.83 
 
 
603 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  46.75 
 
 
585 aa  369  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  44.42 
 
 
536 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  43.49 
 
 
564 aa  311  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  45.55 
 
 
551 aa  290  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  34.15 
 
 
547 aa  284  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  42 
 
 
552 aa  272  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  40.6 
 
 
562 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  44.89 
 
 
563 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  40.71 
 
 
550 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
548 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  36.97 
 
 
546 aa  250  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  39.25 
 
 
553 aa  244  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  38.38 
 
 
551 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.07 
 
 
635 aa  226  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.65 
 
 
548 aa  225  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  35.08 
 
 
563 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.62 
 
 
635 aa  224  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  39.41 
 
 
540 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  30.12 
 
 
641 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.09 
 
 
637 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  30.47 
 
 
658 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  30.3 
 
 
658 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  30.3 
 
 
658 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  30.3 
 
 
644 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  30.3 
 
 
658 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  30.65 
 
 
640 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  30.3 
 
 
659 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  30.3 
 
 
658 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  30.24 
 
 
659 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  30.3 
 
 
644 aa  213  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  28.65 
 
 
644 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  30.3 
 
 
662 aa  212  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  36.66 
 
 
566 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  30.32 
 
 
879 aa  210  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.62 
 
 
634 aa  210  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  30.34 
 
 
540 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  33.92 
 
 
554 aa  209  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  30.51 
 
 
540 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  32.1 
 
 
545 aa  207  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
639 aa  206  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  30.9 
 
 
632 aa  205  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  29.49 
 
 
543 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  32.43 
 
 
631 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 
637 aa  204  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.07 
 
 
509 aa  203  6e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.047738  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  28.95 
 
 
532 aa  203  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 
532 aa  203  7e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.62 
 
 
637 aa  203  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  31.68 
 
 
637 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  31.68 
 
 
637 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.47 
 
 
644 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  31.68 
 
 
637 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 
637 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  30.32 
 
 
523 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.5 
 
 
637 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.47 
 
 
634 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 
637 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 
637 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 
637 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.66 
 
 
635 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  29.27 
 
 
636 aa  201  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.66 
 
 
635 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 
640 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 
640 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 
640 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  29.03 
 
 
627 aa  200  5e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.66 
 
 
635 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.66 
 
 
635 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.66 
 
 
635 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  30.38 
 
 
667 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  30.16 
 
 
543 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  30.35 
 
 
544 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  31.28 
 
 
630 aa  198  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  27.8 
 
 
642 aa  197  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  30.43 
 
 
542 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  34.05 
 
 
545 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  27.45 
 
 
632 aa  196  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 
515 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  35.51 
 
 
551 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  29.49 
 
 
552 aa  196  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  25.58 
 
 
642 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3988  ABC transporter, ATPase subunit  30.91 
 
 
533 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  25.58 
 
 
642 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  25.75 
 
 
643 aa  196  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 
631 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 
631 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.08 
 
 
550 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  32.68 
 
 
638 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4100  ABC transporter-related protein  30.73 
 
 
533 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  30.59 
 
 
620 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  31.46 
 
 
631 aa  193  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  28.88 
 
 
642 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  30.73 
 
 
630 aa  193  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 
631 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  29.98 
 
 
653 aa  193  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>