More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1571 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  62.9 
 
 
631 aa  811    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  100 
 
 
631 aa  1282    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  63.06 
 
 
631 aa  811    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  52.09 
 
 
653 aa  677    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  62.58 
 
 
631 aa  807    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  62.9 
 
 
631 aa  813    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  62.9 
 
 
631 aa  813    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  64.59 
 
 
630 aa  830    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  62.58 
 
 
631 aa  807    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  49.6 
 
 
639 aa  646    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  62.58 
 
 
631 aa  810    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  63.06 
 
 
631 aa  814    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  62.1 
 
 
631 aa  803    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  62.58 
 
 
631 aa  809    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  49.92 
 
 
636 aa  634  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  50 
 
 
643 aa  615  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  49.92 
 
 
642 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  49.76 
 
 
642 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  50 
 
 
625 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  48.73 
 
 
632 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  47.62 
 
 
630 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  45.62 
 
 
642 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  45.31 
 
 
642 aa  593  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 
627 aa  590  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  45.47 
 
 
642 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  47.13 
 
 
629 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  46.82 
 
 
646 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  46.75 
 
 
625 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  46.75 
 
 
625 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  46.6 
 
 
632 aa  566  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  47.87 
 
 
630 aa  566  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  46.57 
 
 
640 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  46.5 
 
 
626 aa  560  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  45.79 
 
 
629 aa  558  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  45.03 
 
 
613 aa  549  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  46.83 
 
 
631 aa  549  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 
622 aa  542  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  48.57 
 
 
623 aa  544  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  45.03 
 
 
620 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  43.88 
 
 
622 aa  534  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  42.79 
 
 
621 aa  532  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  45.67 
 
 
641 aa  530  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  46.2 
 
 
626 aa  528  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  43.19 
 
 
630 aa  525  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  43.26 
 
 
634 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  43.01 
 
 
630 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  42.22 
 
 
620 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
623 aa  492  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  42.7 
 
 
633 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  41.73 
 
 
652 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  41.82 
 
 
631 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  39.94 
 
 
641 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  40.86 
 
 
622 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  39.78 
 
 
641 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  40.55 
 
 
644 aa  462  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  39.16 
 
 
641 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  41.72 
 
 
634 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  39.91 
 
 
663 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  40 
 
 
636 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  38.14 
 
 
645 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  38.29 
 
 
641 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  37.95 
 
 
688 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  37.64 
 
 
661 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  37.79 
 
 
649 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  37.64 
 
 
661 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  39.4 
 
 
636 aa  422  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  38.96 
 
 
632 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  38.21 
 
 
642 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.83 
 
 
564 aa  419  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  37.11 
 
 
649 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  37.65 
 
 
648 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 
648 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 
660 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 
660 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 
648 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  38.85 
 
 
654 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  37.58 
 
 
649 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 
648 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 
660 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  37.98 
 
 
649 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 
1065 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  38.81 
 
 
633 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  37.81 
 
 
626 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  39.18 
 
 
636 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  40.57 
 
 
723 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  38.83 
 
 
656 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  37.72 
 
 
640 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
648 aa  412  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
559 aa  409  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 
563 aa  409  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1816  ABC transporter-related protein  39.51 
 
 
654 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0210138  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 
551 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  37 
 
 
640 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.3 
 
 
563 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 
559 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  37.19 
 
 
632 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  37.36 
 
 
648 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  37.98 
 
 
651 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.15 
 
 
555 aa  395  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.23 
 
 
559 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>