More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0889 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  100 
 
 		 554 aa  1129    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  60.22 
 
 		 548 aa  618  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  54.76 
 
 		 553 aa  567  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  50.81 
 
 		 552 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1063  ABC transporter related protein  56.2 
 
 		 671 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 548 aa  349  7e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 562 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  40.47 
 
 		 566 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.67 
 
 		 600 aa  310  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  39.09 
 
 		 540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.86 
 
 		 509 aa  257  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.047738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  33.99 
 
 		 537 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  34.1 
 
 		 563 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  33.88 
 
 		 536 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.09 
 
 		 564 aa  209  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  32.71 
 
 		 546 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  30.67 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  32.45 
 
 		 563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  34.52 
 
 		 561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  34.91 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.89 
 
 		 583 aa  193  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.1 
 
 		 585 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  29.51 
 
 		 631 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  31.31 
 
 		 603 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  28.36 
 
 		 636 aa  177  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  27.57 
 
 		 636 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  30.77 
 
 		 631 aa  173  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  28.22 
 
 		 535 aa  172  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0904  ABC transporter related  29.7 
 
 		 527 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467195  decreased coverage  0.00659199 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.5 
 
 		 559 aa  171  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  30.52 
 
 		 648 aa  171  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  28.47 
 
 		 653 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2203  ABC transporter related  29.13 
 
 		 669 aa  170  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  26.75 
 
 		 639 aa  170  8e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  29.95 
 
 		 606 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4062  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.13 
 
 		 554 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.247157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.25 
 
 		 635 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.63 
 
 		 637 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.01 
 
 		 635 aa  167  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  29.92 
 
 		 533 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.1 
 
 		 637 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  27.57 
 
 		 646 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.86 
 
 		 551 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  28.92 
 
 		 637 aa  166  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  28.92 
 
 		 637 aa  166  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  26.79 
 
 		 663 aa  166  9e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  28.92 
 
 		 637 aa  166  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 		 637 aa  166  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.04 
 
 		 560 aa  166  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 		 637 aa  166  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 		 637 aa  166  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0967  ABC transporter, ATP-binding protein  27.75 
 
 		 643 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 		 637 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  27.37 
 
 		 643 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.89 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  30.09 
 
 		 632 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  27.47 
 
 		 536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  29.87 
 
 		 630 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.33 
 
 		 635 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.33 
 
 		 635 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  26.71 
 
 		 634 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.04 
 
 		 551 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  26.61 
 
 		 663 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.68 
 
 		 560 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  26.49 
 
 		 642 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  29.2 
 
 		 625 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.04 
 
 		 551 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.73 
 
 		 637 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.98 
 
 		 559 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0250  ATPase  27.56 
 
 		 662 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  26.3 
 
 		 606 aa  164  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.33 
 
 		 635 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.33 
 
 		 635 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  27.19 
 
 		 643 aa  163  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.41 
 
 		 558 aa  163  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  28.11 
 
 		 644 aa  163  6e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.96 
 
 		 556 aa  163  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.33 
 
 		 635 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  27.32 
 
 		 620 aa  163  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0931  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.94 
 
 		 560 aa  163  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.93 
 
 		 561 aa  163  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2338  ABC transporter related protein  30.44 
 
 		 635 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.28 
 
 		 558 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.6 
 
 		 557 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  30.37 
 
 		 626 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.68 
 
 		 553 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  27.82 
 
 		 640 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.35 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  28.55 
 
 		 632 aa  161  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2686  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.78 
 
 		 549 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530992  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  27.75 
 
 		 564 aa  161  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  26.64 
 
 		 685 aa  161  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.3 
 
 		 556 aa  161  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  27.12 
 
 		 644 aa  161  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  29.08 
 
 		 555 aa  161  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.21 
 
 		 559 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  26.79 
 
 		 629 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.62 
 
 		 561 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.6 
 
 		 557 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.62 
 
 		 561 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>