More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17540 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 509 aa  963    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.047738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  50.93 
 
 		 566 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 562 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  48.86 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  45.52 
 
 		 548 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  42.98 
 
 		 600 aa  355  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  40.72 
 
 		 552 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  39.1 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  36.04 
 
 		 554 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.63 
 
 		 548 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  38.5 
 
 		 537 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.41 
 
 		 583 aa  229  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 563 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  37.79 
 
 		 561 aa  210  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  36.21 
 
 		 536 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1063  ABC transporter related protein  41.36 
 
 		 671 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.01 
 
 		 550 aa  196  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.76 
 
 		 585 aa  192  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  33.71 
 
 		 546 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.42 
 
 		 564 aa  187  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  31.88 
 
 		 563 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  24.95 
 
 		 606 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  34.56 
 
 		 603 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  35.96 
 
 		 563 aa  180  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  29.81 
 
 		 627 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  32.18 
 
 		 630 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  33.09 
 
 		 544 aa  177  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  31.65 
 
 		 553 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  31.65 
 
 		 553 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  31.65 
 
 		 553 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  32.02 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  28.25 
 
 		 641 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  28.94 
 
 		 547 aa  174  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  31.65 
 
 		 648 aa  174  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  30.38 
 
 		 640 aa  174  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  30.19 
 
 		 627 aa  173  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.92 
 
 		 637 aa  173  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  34.34 
 
 		 551 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  31.51 
 
 		 532 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.84 
 
 		 555 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  30.92 
 
 		 642 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3138  ABC transporter related  31.98 
 
 		 621 aa  170  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00577211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  33.33 
 
 		 672 aa  170  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  33.09 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  33.89 
 
 		 550 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  30.71 
 
 		 637 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  30.71 
 
 		 637 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  30.71 
 
 		 637 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 		 637 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 		 637 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 		 637 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 		 637 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2338  ABC transporter related protein  34.54 
 
 		 635 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.86 
 
 		 639 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 		 637 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  32.42 
 
 		 553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  28.22 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 		 637 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  26.42 
 
 		 634 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1341  ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 645 aa  167  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  33.39 
 
 		 551 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1276  ABC transporter related  32.39 
 
 		 645 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  32.65 
 
 		 650 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1433  ABC transporter related protein  25.74 
 
 		 649 aa  166  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  32.33 
 
 		 624 aa  166  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.6 
 
 		 635 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0967  ABC transporter, ATP-binding protein  25.99 
 
 		 643 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1830  hypothetical protein  28.54 
 
 		 616 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  27.46 
 
 		 644 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  30.65 
 
 		 615 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.6 
 
 		 635 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.6 
 
 		 635 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.29 
 
 		 635 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.78 
 
 		 532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  24.86 
 
 		 643 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  30.65 
 
 		 615 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 		 635 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  30.17 
 
 		 537 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1833  hypothetical protein  28.22 
 
 		 616 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  32.72 
 
 		 542 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  29.33 
 
 		 632 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  25.05 
 
 		 643 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  27.93 
 
 		 685 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  26.07 
 
 		 646 aa  163  6e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  31.39 
 
 		 625 aa  163  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  28.33 
 
 		 654 aa  163  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.02 
 
 		 635 aa  163  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  29.64 
 
 		 532 aa  163  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21830  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.02 
 
 		 532 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  31.33 
 
 		 635 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.83 
 
 		 635 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  32.1 
 
 		 548 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  27.6 
 
 		 533 aa  161  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  30.75 
 
 		 625 aa  162  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  26.27 
 
 		 644 aa  161  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  24.32 
 
 		 645 aa  162  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  35.31 
 
 		 550 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  29.3 
 
 		 528 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  25.42 
 
 		 625 aa  161  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>