More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21830 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  78.01 
 
 
532 aa  816    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  72.74 
 
 
532 aa  762    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  65.92 
 
 
552 aa  671    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1160  ABC transporter related  75.19 
 
 
532 aa  788    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  65.87 
 
 
542 aa  696    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2465  ABC transporter related protein  64.33 
 
 
541 aa  664    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0270517  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  66.98 
 
 
533 aa  704    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3301  ABC transporter related  65.74 
 
 
534 aa  666    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2326  ABC transporter related  75.94 
 
 
532 aa  793    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386504  normal  0.590728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2238  ABC transporter related protein  68.42 
 
 
532 aa  702    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000471653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  68.42 
 
 
532 aa  707    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5972  ABC transporter, ATP-binding protein  68.23 
 
 
532 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.490457  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16300  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  66.97 
 
 
542 aa  658    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  70.86 
 
 
532 aa  748    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2802  ABC transporter related protein  68.23 
 
 
532 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15491  normal  0.0601311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  67.98 
 
 
534 aa  714    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  67.04 
 
 
537 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2204  ABC transporter related  67.23 
 
 
537 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2289  ABC transporter related  63.96 
 
 
541 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000329331  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  71.05 
 
 
537 aa  772    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2483  ABC transporter related  65.87 
 
 
542 aa  700    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2446  ABC transporter related  65.87 
 
 
542 aa  700    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  70.11 
 
 
532 aa  735    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  81.39 
 
 
532 aa  856    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  64.21 
 
 
542 aa  679    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2396  ABC transporter related protein  64.21 
 
 
542 aa  669    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.647694  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13460  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  68.42 
 
 
532 aa  691    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.576158  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  70.49 
 
 
532 aa  741    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5134  ABC transporter related  68.82 
 
 
542 aa  717    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707972  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21830  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  100 
 
 
532 aa  1072    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  68.23 
 
 
532 aa  734    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
533 aa  659    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2491  ABC transporter related  65.87 
 
 
542 aa  700    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11427  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  65.13 
 
 
563 aa  694    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.676431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  62.92 
 
 
542 aa  671    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  66.73 
 
 
532 aa  661    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.346167 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  63.64 
 
 
533 aa  676    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  61.22 
 
 
539 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 
540 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  35.74 
 
 
630 aa  334  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  35.28 
 
 
643 aa  333  5e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  35.35 
 
 
637 aa  332  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.69 
 
 
541 aa  332  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  37.24 
 
 
668 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 
545 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  36.75 
 
 
540 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  34.94 
 
 
638 aa  323  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  36.69 
 
 
540 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  36.69 
 
 
540 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  35.33 
 
 
540 aa  323  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  36.35 
 
 
540 aa  323  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  36.87 
 
 
540 aa  323  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  36.83 
 
 
548 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 
632 aa  320  3e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  36.48 
 
 
540 aa  320  5e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  35.93 
 
 
540 aa  319  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  35.86 
 
 
646 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  35.96 
 
 
540 aa  318  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  35.38 
 
 
540 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.01 
 
 
709 aa  316  5e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  36.26 
 
 
548 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  36.33 
 
 
565 aa  316  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  36.1 
 
 
653 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  36.07 
 
 
548 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  36.33 
 
 
685 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  38.04 
 
 
688 aa  312  7.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  35 
 
 
539 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  35.57 
 
 
560 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  35.63 
 
 
535 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  36.2 
 
 
641 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 
663 aa  310  4e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  36.07 
 
 
650 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  35.59 
 
 
767 aa  309  8e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  35.38 
 
 
540 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  34.62 
 
 
540 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  36.42 
 
 
663 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  33.21 
 
 
634 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  36.14 
 
 
651 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  34.62 
 
 
540 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  36.02 
 
 
690 aa  306  5.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  35.99 
 
 
645 aa  306  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  35.97 
 
 
656 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  35.43 
 
 
652 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  36.21 
 
 
659 aa  304  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  34.66 
 
 
543 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  35.29 
 
 
567 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  35.79 
 
 
652 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 
645 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  35.21 
 
 
540 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  35.92 
 
 
672 aa  303  7.000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  34.96 
 
 
650 aa  302  8.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  37.26 
 
 
656 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  35.18 
 
 
667 aa  302  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  34.82 
 
 
545 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  35.71 
 
 
542 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  35.95 
 
 
549 aa  300  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  33.71 
 
 
639 aa  300  5e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.18 
 
 
575 aa  300  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  32.68 
 
 
544 aa  300  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  34.95 
 
 
540 aa  299  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>