More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3074 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  67.04 
 
 		 537 aa  723    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  66.67 
 
 		 532 aa  704    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  64.43 
 
 		 532 aa  676    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5972  ABC transporter, ATP-binding protein  69.09 
 
 		 532 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.490457  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2204  ABC transporter related  70.26 
 
 		 537 aa  693    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  73.61 
 
 		 533 aa  774    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  64.8 
 
 		 532 aa  656    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2396  ABC transporter related protein  67.9 
 
 		 542 aa  708    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.647694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2289  ABC transporter related  69.5 
 
 		 541 aa  721    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000329331  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16300  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  73.25 
 
 		 542 aa  712    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2802  ABC transporter related protein  67.23 
 
 		 532 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15491  normal  0.0601311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5134  ABC transporter related  73.66 
 
 		 542 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707972  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  69.43 
 
 		 542 aa  734    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2326  ABC transporter related  68.16 
 
 		 532 aa  695    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386504  normal  0.590728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3301  ABC transporter related  97.57 
 
 		 534 aa  986    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016254 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  69.7 
 
 		 537 aa  687    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  69.83 
 
 		 532 aa  726    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2238  ABC transporter related protein  67.97 
 
 		 532 aa  682    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000471653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  66.29 
 
 		 532 aa  642    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.346167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  67.77 
 
 		 542 aa  706    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  66.91 
 
 		 532 aa  681    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  61.78 
 
 		 534 aa  651    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2446  ABC transporter related  68.45 
 
 		 542 aa  729    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1160  ABC transporter related  64.99 
 
 		 532 aa  669    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2465  ABC transporter related protein  77.49 
 
 		 541 aa  803    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  100 
 
 		 552 aa  1101    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21830  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  65.92 
 
 		 532 aa  689    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  66.24 
 
 		 542 aa  707    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  66.48 
 
 		 532 aa  699    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  69.09 
 
 		 532 aa  714    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  64.87 
 
 		 532 aa  677    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2491  ABC transporter related  68.45 
 
 		 542 aa  729    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  66.79 
 
 		 563 aa  728    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676431 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13460  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  67.23 
 
 		 532 aa  660    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.576158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2483  ABC transporter related  68.45 
 
 		 542 aa  729    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  57.79 
 
 		 533 aa  586  1e-166  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  58.82 
 
 		 539 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 		 533 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  35.95 
 
 		 643 aa  323  7e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 632 aa  313  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  35.63 
 
 		 672 aa  312  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  36.42 
 
 		 630 aa  311  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  35.35 
 
 		 637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  36.16 
 
 		 668 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  37.52 
 
 		 767 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  35.34 
 
 		 544 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  36.19 
 
 		 690 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  33.65 
 
 		 643 aa  301  3e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  34.92 
 
 		 645 aa  299  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  35.43 
 
 		 638 aa  299  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 641 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  33.91 
 
 		 535 aa  297  3e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  34.63 
 
 		 545 aa  296  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  35.89 
 
 		 540 aa  296  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  34.82 
 
 		 646 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  34.78 
 
 		 649 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  37.02 
 
 		 540 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  35.16 
 
 		 540 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  34.19 
 
 		 685 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  35.34 
 
 		 649 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  37.01 
 
 		 620 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  33.59 
 
 		 639 aa  293  4e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  34.44 
 
 		 664 aa  293  5e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  31.46 
 
 		 634 aa  293  8e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  34.89 
 
 		 540 aa  292  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  35.96 
 
 		 656 aa  292  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.36 
 
 		 709 aa  292  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  34.5 
 
 		 653 aa  291  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  36.45 
 
 		 540 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  35.15 
 
 		 663 aa  290  4e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  36.45 
 
 		 540 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  35.15 
 
 		 663 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  34.94 
 
 		 651 aa  289  7e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  34.44 
 
 		 650 aa  290  7e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  33.15 
 
 		 644 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  34.55 
 
 		 543 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  37.02 
 
 		 659 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  35.28 
 
 		 643 aa  287  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  34.6 
 
 		 659 aa  286  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  34.37 
 
 		 545 aa  286  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  35.22 
 
 		 540 aa  286  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  35.4 
 
 		 540 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 643 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  33.58 
 
 		 539 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 641 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.77 
 
 		 540 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  33.52 
 
 		 565 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  31.19 
 
 		 536 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  34.25 
 
 		 650 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  33.94 
 
 		 544 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2630  ABC transporter-related protein  33.77 
 
 		 545 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  34.06 
 
 		 666 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  39.16 
 
 		 642 aa  283  8.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 		 545 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  34.92 
 
 		 652 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 645 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  33.21 
 
 		 630 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  33.4 
 
 		 564 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  36.07 
 
 		 540 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  34.18 
 
 		 638 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>