More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1880 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2465  ABC transporter related protein  63.77 
 
 		 541 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  70.3 
 
 		 537 aa  760    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2802  ABC transporter related protein  79.89 
 
 		 532 aa  825    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15491  normal  0.0601311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  64.09 
 
 		 542 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13460  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  70.11 
 
 		 532 aa  702    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.576158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  64.27 
 
 		 542 aa  674    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16300  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  67.9 
 
 		 542 aa  664    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5134  ABC transporter related  66.05 
 
 		 542 aa  693    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707972  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  100 
 
 		 532 aa  1051    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  60.89 
 
 		 542 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2204  ABC transporter related  69.46 
 
 		 537 aa  679    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2238  ABC transporter related protein  78.01 
 
 		 532 aa  783    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000471653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2396  ABC transporter related protein  62.36 
 
 		 542 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.647694  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2326  ABC transporter related  71.24 
 
 		 532 aa  736    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386504  normal  0.590728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  69.27 
 
 		 537 aa  677    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2483  ABC transporter related  63.9 
 
 		 542 aa  682    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  67.86 
 
 		 532 aa  714    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  70.11 
 
 		 532 aa  742    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1160  ABC transporter related  66.54 
 
 		 532 aa  697    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3301  ABC transporter related  64.25 
 
 		 534 aa  635    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2446  ABC transporter related  63.9 
 
 		 542 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  67.54 
 
 		 533 aa  702    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  64.75 
 
 		 539 aa  658    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2289  ABC transporter related  63.85 
 
 		 541 aa  647    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000329331  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  69.17 
 
 		 532 aa  724    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  67.6 
 
 		 534 aa  711    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  75.94 
 
 		 532 aa  738    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.346167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  69.74 
 
 		 532 aa  738    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5972  ABC transporter, ATP-binding protein  76.5 
 
 		 532 aa  738    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.490457  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21830  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  68.42 
 
 		 532 aa  712    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  70.68 
 
 		 532 aa  758    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2491  ABC transporter related  63.9 
 
 		 542 aa  682    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  64.8 
 
 		 552 aa  639    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  63.54 
 
 		 563 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  71.24 
 
 		 532 aa  755    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  69.74 
 
 		 532 aa  725    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  60.11 
 
 		 533 aa  633  1e-180  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  37.38 
 
 		 638 aa  336  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 		 632 aa  332  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 767 aa  329  7e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  37.89 
 
 		 672 aa  327  3e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  35.33 
 
 		 637 aa  326  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  35.27 
 
 		 643 aa  325  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  36.52 
 
 		 535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  38.6 
 
 		 620 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  35.19 
 
 		 630 aa  318  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  35.69 
 
 		 646 aa  317  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  35.01 
 
 		 544 aa  315  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  38.46 
 
 		 540 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  36.58 
 
 		 668 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  37.35 
 
 		 545 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  34.1 
 
 		 634 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  36.89 
 
 		 685 aa  312  1e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  37.84 
 
 		 540 aa  312  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  36.33 
 
 		 540 aa  312  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  37.84 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  35.77 
 
 		 644 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  36.75 
 
 		 540 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  37.06 
 
 		 663 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  35.67 
 
 		 540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  35.99 
 
 		 540 aa  307  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  38.64 
 
 		 667 aa  307  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  37.06 
 
 		 663 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  35.28 
 
 		 645 aa  306  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  33.73 
 
 		 666 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  36.26 
 
 		 564 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.45 
 
 		 709 aa  305  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.5 
 
 		 541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.5 
 
 		 640 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.31 
 
 		 640 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.5 
 
 		 640 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  36.05 
 
 		 656 aa  304  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  34.81 
 
 		 540 aa  303  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  35.69 
 
 		 540 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  37.71 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  37.74 
 
 		 659 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  38.21 
 
 		 574 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  35.89 
 
 		 641 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  37.94 
 
 		 548 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  36.52 
 
 		 690 aa  300  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  35.28 
 
 		 575 aa  300  6e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  37.52 
 
 		 548 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  35.82 
 
 		 540 aa  299  9e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  36.25 
 
 		 540 aa  299  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  36.41 
 
 		 540 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  36.65 
 
 		 667 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  36.74 
 
 		 567 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  35.32 
 
 		 653 aa  298  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  35.8 
 
 		 565 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 624 aa  298  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  35.26 
 
 		 540 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 637 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 		 645 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  35.59 
 
 		 560 aa  296  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 		 635 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  36.85 
 
 		 638 aa  296  9e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  34.83 
 
 		 540 aa  296  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  35.02 
 
 		 540 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 641 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>