More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2396 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  63.17 
 
 		 532 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3301  ABC transporter related  68.08 
 
 		 534 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  63.65 
 
 		 532 aa  662    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  68.88 
 
 		 533 aa  721    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2326  ABC transporter related  66.61 
 
 		 532 aa  679    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386504  normal  0.590728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2465  ABC transporter related protein  66.3 
 
 		 541 aa  693    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  62.36 
 
 		 532 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  60.41 
 
 		 534 aa  640    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2289  ABC transporter related  74.59 
 
 		 541 aa  775    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000329331  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  63.47 
 
 		 532 aa  676    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  84.32 
 
 		 542 aa  911    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2396  ABC transporter related protein  100 
 
 		 542 aa  1083    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.647694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5134  ABC transporter related  75.78 
 
 		 542 aa  810    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5972  ABC transporter, ATP-binding protein  65.68 
 
 		 532 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.490457  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  66.61 
 
 		 537 aa  672    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  67.9 
 
 		 552 aa  691    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2802  ABC transporter related protein  65.68 
 
 		 532 aa  665    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15491  normal  0.0601311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  65.13 
 
 		 537 aa  709    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2446  ABC transporter related  84.5 
 
 		 542 aa  916    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16300  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  77.94 
 
 		 542 aa  778    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2204  ABC transporter related  68.45 
 
 		 537 aa  690    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  83.98 
 
 		 542 aa  908    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  81.92 
 
 		 542 aa  883    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  65.31 
 
 		 532 aa  666    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21830  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  64.21 
 
 		 532 aa  673    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  64.21 
 
 		 532 aa  666    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  62.92 
 
 		 532 aa  666    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2238  ABC transporter related protein  65.5 
 
 		 532 aa  657    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000471653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  62.36 
 
 		 532 aa  656    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2483  ABC transporter related  84.5 
 
 		 542 aa  916    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2491  ABC transporter related  84.5 
 
 		 542 aa  916    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  85.42 
 
 		 563 aa  924    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1160  ABC transporter related  61.62 
 
 		 532 aa  632  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  63.65 
 
 		 532 aa  619  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.346167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13460  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  61.69 
 
 		 532 aa  604  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.576158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  56.51 
 
 		 533 aa  578  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  55.95 
 
 		 533 aa  567  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  54.46 
 
 		 539 aa  552  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 		 643 aa  301  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  35.78 
 
 		 685 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  35.31 
 
 		 630 aa  296  7e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 		 540 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  33.72 
 
 		 637 aa  293  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 663 aa  293  6e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 663 aa  293  7e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  34.18 
 
 		 545 aa  290  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  34.02 
 
 		 767 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  34.87 
 
 		 646 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  34.16 
 
 		 540 aa  286  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.46 
 
 		 668 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  34.16 
 
 		 645 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  33.97 
 
 		 544 aa  284  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  33.78 
 
 		 540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  33.78 
 
 		 540 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 		 645 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  31.83 
 
 		 632 aa  280  6e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.99 
 
 		 543 aa  279  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  34.36 
 
 		 690 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  33.33 
 
 		 540 aa  278  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  35.42 
 
 		 549 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  34.61 
 
 		 641 aa  278  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  34.48 
 
 		 638 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  36.21 
 
 		 659 aa  277  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  34.25 
 
 		 540 aa  276  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  37.57 
 
 		 545 aa  276  8e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  33.76 
 
 		 540 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  33.27 
 
 		 540 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.32 
 
 		 709 aa  275  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  35.28 
 
 		 544 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 688 aa  274  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  35.53 
 
 		 656 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  32.88 
 
 		 639 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  36.29 
 
 		 620 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  36.17 
 
 		 542 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  34.29 
 
 		 564 aa  273  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  31.98 
 
 		 634 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.12 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  33.4 
 
 		 540 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  36.53 
 
 		 540 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.04 
 
 		 541 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  34.1 
 
 		 545 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  34.82 
 
 		 649 aa  270  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  36.35 
 
 		 540 aa  270  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  33.33 
 
 		 540 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  34.06 
 
 		 540 aa  270  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  33.93 
 
 		 548 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.51 
 
 		 640 aa  269  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.31 
 
 		 640 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.51 
 
 		 640 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  32.42 
 
 		 560 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  33.88 
 
 		 567 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  33.73 
 
 		 548 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  33.47 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  33.01 
 
 		 540 aa  267  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  34.16 
 
 		 649 aa  267  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  32.38 
 
 		 653 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  37.12 
 
 		 645 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.96 
 
 		 559 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  32.24 
 
 		 565 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  32.61 
 
 		 540 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>