More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5972 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  63.82 
 
 		 539 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  66.97 
 
 		 542 aa  709    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  74.62 
 
 		 532 aa  788    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  69.09 
 
 		 552 aa  691    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16300  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  68.63 
 
 		 542 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  69.74 
 
 		 532 aa  739    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  64.76 
 
 		 542 aa  683    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  76.5 
 
 		 532 aa  778    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  69.55 
 
 		 532 aa  719    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  65.31 
 
 		 542 aa  685    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2238  ABC transporter related protein  80.45 
 
 		 532 aa  816    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000471653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2465  ABC transporter related protein  68.27 
 
 		 541 aa  691    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2289  ABC transporter related  68.02 
 
 		 541 aa  680    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000329331  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  81.2 
 
 		 532 aa  809    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.346167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  73.31 
 
 		 537 aa  791    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  72.56 
 
 		 532 aa  775    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  70.76 
 
 		 537 aa  700    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  65.36 
 
 		 534 aa  690    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5134  ABC transporter related  69.19 
 
 		 542 aa  721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  72.98 
 
 		 533 aa  764    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5972  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 532 aa  1049    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.490457  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  71.8 
 
 		 532 aa  745    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2446  ABC transporter related  67.71 
 
 		 542 aa  709    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1160  ABC transporter related  66.17 
 
 		 532 aa  686    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21830  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  68.23 
 
 		 532 aa  714    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2326  ABC transporter related  73.12 
 
 		 532 aa  756    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386504  normal  0.590728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  71.8 
 
 		 532 aa  763    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2802  ABC transporter related protein  75.94 
 
 		 532 aa  787    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15491  normal  0.0601311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13460  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  68.8 
 
 		 532 aa  694    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.576158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  74.62 
 
 		 532 aa  792    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2491  ABC transporter related  67.71 
 
 		 542 aa  709    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  66.24 
 
 		 563 aa  704    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2396  ABC transporter related protein  65.68 
 
 		 542 aa  683    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.647694  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2204  ABC transporter related  71.88 
 
 		 537 aa  710    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2483  ABC transporter related  67.71 
 
 		 542 aa  709    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3301  ABC transporter related  69.09 
 
 		 534 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016254 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  59.92 
 
 		 533 aa  608  1e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  59.74 
 
 		 533 aa  605  9.999999999999999e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  36.85 
 
 		 767 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  34.76 
 
 		 637 aa  319  7.999999999999999e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 		 643 aa  317  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  36.03 
 
 		 672 aa  316  7e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  37.7 
 
 		 545 aa  310  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  34.6 
 
 		 630 aa  310  5.9999999999999995e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  35.09 
 
 		 638 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  33.84 
 
 		 634 aa  307  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  35.56 
 
 		 664 aa  305  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  34.32 
 
 		 535 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.35 
 
 		 668 aa  303  7.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  36.01 
 
 		 540 aa  302  9e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  36.31 
 
 		 540 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  35.11 
 
 		 645 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 		 632 aa  300  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  34.3 
 
 		 646 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  38.21 
 
 		 667 aa  300  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  35.62 
 
 		 549 aa  299  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  34.64 
 
 		 540 aa  299  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  36.68 
 
 		 544 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  37.4 
 
 		 690 aa  298  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  35.6 
 
 		 685 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  32.56 
 
 		 544 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  35.75 
 
 		 540 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  34.08 
 
 		 639 aa  298  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  35.58 
 
 		 543 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  35.75 
 
 		 540 aa  297  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.95 
 
 		 541 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  34.39 
 
 		 540 aa  296  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  34.76 
 
 		 651 aa  295  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.63 
 
 		 540 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.78 
 
 		 645 aa  293  4e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 		 640 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 		 640 aa  293  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 540 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 		 640 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 		 663 aa  293  6e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  36.31 
 
 		 620 aa  292  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  35.33 
 
 		 540 aa  292  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.66 
 
 		 637 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 		 663 aa  292  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  34.03 
 
 		 641 aa  292  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  36.89 
 
 		 540 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  35.12 
 
 		 650 aa  291  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  34.95 
 
 		 650 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  31.58 
 
 		 643 aa  291  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  36.9 
 
 		 659 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.83 
 
 		 709 aa  290  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  34.57 
 
 		 540 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  32.55 
 
 		 666 aa  290  7e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  37.66 
 
 		 548 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  34.02 
 
 		 540 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  33.58 
 
 		 540 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  35.74 
 
 		 542 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  34.99 
 
 		 565 aa  289  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 545 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  34.14 
 
 		 653 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 624 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  35.19 
 
 		 638 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  33.91 
 
 		 539 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  33.08 
 
 		 545 aa  287  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  35.01 
 
 		 649 aa  286  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>