More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0817 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21830  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  62.5 
 
 		 532 aa  659    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  60.11 
 
 		 532 aa  634    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  62.19 
 
 		 537 aa  667    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  63.14 
 
 		 532 aa  668    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1160  ABC transporter related  63.71 
 
 		 532 aa  669    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  87.62 
 
 		 533 aa  937    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  61.36 
 
 		 532 aa  646    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  61.13 
 
 		 534 aa  655    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  63.72 
 
 		 532 aa  662    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2326  ABC transporter related  62.38 
 
 		 532 aa  654    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386504  normal  0.590728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  60.98 
 
 		 532 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 533 aa  1092    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  62.57 
 
 		 532 aa  656    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  63.33 
 
 		 532 aa  664    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13460  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  62.12 
 
 		 532 aa  623  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.576158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2802  ABC transporter related protein  61.86 
 
 		 532 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15491  normal  0.0601311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  59.36 
 
 		 532 aa  617  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2238  ABC transporter related protein  59.55 
 
 		 532 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000471653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5134  ABC transporter related  57.43 
 
 		 542 aa  588  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  55.77 
 
 		 533 aa  586  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2483  ABC transporter related  55.76 
 
 		 542 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2446  ABC transporter related  55.76 
 
 		 542 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2491  ABC transporter related  55.76 
 
 		 542 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  57.47 
 
 		 532 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.346167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  56.32 
 
 		 542 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 		 542 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  55.02 
 
 		 542 aa  578  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  55.76 
 
 		 563 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  56.16 
 
 		 539 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2289  ABC transporter related  56.24 
 
 		 541 aa  565  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000329331  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  55.91 
 
 		 552 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5972  ABC transporter, ATP-binding protein  59.74 
 
 		 532 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.490457  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3301  ABC transporter related  56.1 
 
 		 534 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2396  ABC transporter related protein  55.95 
 
 		 542 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.647694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2465  ABC transporter related protein  55.87 
 
 		 541 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16300  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  56.88 
 
 		 542 aa  547  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  55.3 
 
 		 537 aa  542  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2204  ABC transporter related  55.95 
 
 		 537 aa  544  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 540 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  36.18 
 
 		 638 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.42 
 
 		 541 aa  325  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  36.22 
 
 		 540 aa  323  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  36.79 
 
 		 540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  36.79 
 
 		 540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.56 
 
 		 548 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  35.02 
 
 		 540 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  35.62 
 
 		 540 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  35.18 
 
 		 548 aa  320  5e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  36.62 
 
 		 565 aa  319  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.49 
 
 		 540 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  35.18 
 
 		 548 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  35.08 
 
 		 540 aa  319  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  35.02 
 
 		 540 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  34.96 
 
 		 545 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  35.21 
 
 		 540 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  34.68 
 
 		 540 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  35.03 
 
 		 540 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  34.82 
 
 		 539 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.84 
 
 		 668 aa  312  9e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  34.66 
 
 		 672 aa  311  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  34.41 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  34.91 
 
 		 560 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  34.75 
 
 		 643 aa  310  4e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  33.96 
 
 		 540 aa  309  8e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  34.62 
 
 		 637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  33.64 
 
 		 685 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  33.66 
 
 		 540 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  32.82 
 
 		 634 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  33.86 
 
 		 646 aa  303  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  34.64 
 
 		 663 aa  302  8.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  33.06 
 
 		 639 aa  302  9e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  32.59 
 
 		 666 aa  302  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.15 
 
 		 709 aa  300  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 		 663 aa  299  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  35.12 
 
 		 632 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  36.18 
 
 		 767 aa  298  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  35.21 
 
 		 645 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  33.78 
 
 		 545 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  32.43 
 
 		 630 aa  296  6e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.71 
 
 		 690 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  34.44 
 
 		 620 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  33.46 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  33.46 
 
 		 540 aa  294  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  32.14 
 
 		 659 aa  293  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  33.9 
 
 		 644 aa  293  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  34.56 
 
 		 641 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  34.03 
 
 		 652 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  34.51 
 
 		 688 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  34.38 
 
 		 664 aa  291  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  31.13 
 
 		 643 aa  291  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  33.64 
 
 		 540 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  33.46 
 
 		 540 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  31.97 
 
 		 543 aa  289  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  32.43 
 
 		 544 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  32.89 
 
 		 564 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  33.89 
 
 		 656 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  32.16 
 
 		 544 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 		 645 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  34.2 
 
 		 667 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 		 638 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>