More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2563 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  62.57 
 
 		 533 aa  651    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2802  ABC transporter related protein  70.68 
 
 		 532 aa  736    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15491  normal  0.0601311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  70.04 
 
 		 534 aa  741    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  64.87 
 
 		 552 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  62.57 
 
 		 533 aa  652    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5134  ABC transporter related  65.5 
 
 		 542 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707972  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21830  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  68.23 
 
 		 532 aa  723    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2289  ABC transporter related  63.22 
 
 		 541 aa  640    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000329331  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  70.68 
 
 		 532 aa  738    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  70.11 
 
 		 532 aa  733    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3301  ABC transporter related  64.43 
 
 		 534 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  63.28 
 
 		 542 aa  657    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  65.31 
 
 		 539 aa  662    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  70.3 
 
 		 532 aa  743    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  66.85 
 
 		 537 aa  662    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1160  ABC transporter related  67.29 
 
 		 532 aa  708    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2238  ABC transporter related protein  73.68 
 
 		 532 aa  754    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000471653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  64.76 
 
 		 542 aa  676    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  69.92 
 
 		 532 aa  738    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2465  ABC transporter related protein  65.06 
 
 		 541 aa  657    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5972  ABC transporter, ATP-binding protein  74.62 
 
 		 532 aa  732    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.490457  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  69.04 
 
 		 533 aa  724    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2446  ABC transporter related  63.47 
 
 		 542 aa  664    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  70.68 
 
 		 532 aa  748    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16300  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  66.05 
 
 		 542 aa  651    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  62.36 
 
 		 542 aa  652    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2396  ABC transporter related protein  62.36 
 
 		 542 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.647694  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  73.5 
 
 		 537 aa  790    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  73.31 
 
 		 532 aa  778    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13460  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  70.68 
 
 		 532 aa  716    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.576158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  100 
 
 		 532 aa  1065    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2326  ABC transporter related  74.06 
 
 		 532 aa  774    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386504  normal  0.590728 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2491  ABC transporter related  63.47 
 
 		 542 aa  664    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  64.21 
 
 		 563 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  71.05 
 
 		 532 aa  707    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.346167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2204  ABC transporter related  66.11 
 
 		 537 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2483  ABC transporter related  63.47 
 
 		 542 aa  664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  74.06 
 
 		 532 aa  786    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  35.95 
 
 		 643 aa  325  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 767 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  34.72 
 
 		 637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  35.69 
 
 		 638 aa  317  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  35.24 
 
 		 630 aa  316  6e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.38 
 
 		 634 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.7 
 
 		 709 aa  308  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  35.24 
 
 		 668 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  36.56 
 
 		 664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  37.57 
 
 		 667 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  35.23 
 
 		 544 aa  303  4.0000000000000003e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 		 540 aa  303  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  35.63 
 
 		 645 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  35.64 
 
 		 545 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  34.62 
 
 		 666 aa  301  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 		 632 aa  300  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  36.31 
 
 		 540 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  35.24 
 
 		 685 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  35.17 
 
 		 540 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  38.33 
 
 		 659 aa  297  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 		 663 aa  296  9e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.74 
 
 		 541 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  32 
 
 		 643 aa  294  4e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 		 663 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  35.82 
 
 		 649 aa  293  7e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  35.01 
 
 		 540 aa  293  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  35.14 
 
 		 540 aa  292  8e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  33.94 
 
 		 639 aa  292  9e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  34.58 
 
 		 540 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  36.17 
 
 		 690 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  36.44 
 
 		 649 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 		 640 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.58 
 
 		 645 aa  291  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  34.58 
 
 		 540 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 		 640 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.71 
 
 		 640 aa  291  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  35.12 
 
 		 641 aa  290  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 638 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  35.93 
 
 		 672 aa  288  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  32.74 
 
 		 535 aa  289  1e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  34.79 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  35.29 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  35.06 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.03 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  34.29 
 
 		 539 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  34.58 
 
 		 641 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  33.6 
 
 		 644 aa  287  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 624 aa  286  5e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  35.25 
 
 		 540 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.79 
 
 		 635 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.79 
 
 		 635 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.85 
 
 		 637 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.79 
 
 		 635 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.33 
 
 		 637 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  35.34 
 
 		 641 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 		 637 aa  284  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  33.92 
 
 		 635 aa  284  4.0000000000000003e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0169  ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 		 545 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  37.57 
 
 		 688 aa  283  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  35.55 
 
 		 565 aa  283  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 		 635 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  32.92 
 
 		 651 aa  283  7.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>