More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2059 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  63.65 
 
 		 532 aa  667    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2204  ABC transporter related  66.11 
 
 		 537 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  62.87 
 
 		 532 aa  670    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  83.06 
 
 		 542 aa  895    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3301  ABC transporter related  65.68 
 
 		 534 aa  668    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  62.73 
 
 		 532 aa  661    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  78.45 
 
 		 542 aa  838    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  100 
 
 		 542 aa  1092    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16300  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  75.37 
 
 		 542 aa  753    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  66.48 
 
 		 533 aa  701    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5134  ABC transporter related  76.84 
 
 		 542 aa  814    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707972  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21830  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  62.92 
 
 		 532 aa  660    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  63.28 
 
 		 532 aa  660    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  65.01 
 
 		 537 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2289  ABC transporter related  74.03 
 
 		 541 aa  771    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000329331  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2326  ABC transporter related  64.94 
 
 		 532 aa  670    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386504  normal  0.590728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2446  ABC transporter related  82.5 
 
 		 542 aa  889    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  66.24 
 
 		 537 aa  725    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2802  ABC transporter related protein  64.21 
 
 		 532 aa  655    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15491  normal  0.0601311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2483  ABC transporter related  82.5 
 
 		 542 aa  889    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2238  ABC transporter related protein  63.28 
 
 		 532 aa  635    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000471653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  66.24 
 
 		 552 aa  672    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  62.32 
 
 		 532 aa  660    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2465  ABC transporter related protein  65.88 
 
 		 541 aa  677    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  62.36 
 
 		 532 aa  648    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2491  ABC transporter related  82.5 
 
 		 542 aa  889    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  82.87 
 
 		 563 aa  894    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2396  ABC transporter related protein  83.98 
 
 		 542 aa  891    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.647694  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  60.89 
 
 		 532 aa  633  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  62.18 
 
 		 532 aa  634  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  59.38 
 
 		 534 aa  623  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1160  ABC transporter related  61.07 
 
 		 532 aa  619  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5972  ABC transporter, ATP-binding protein  64.76 
 
 		 532 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.490457  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  61.62 
 
 		 532 aa  600  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.346167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13460  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  60.52 
 
 		 532 aa  589  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.576158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  55.95 
 
 		 533 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 533 aa  566  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  54.83 
 
 		 539 aa  561  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  34.83 
 
 		 540 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  34.24 
 
 		 540 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  36.22 
 
 		 545 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  35.4 
 
 		 540 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  34.47 
 
 		 630 aa  288  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  34.42 
 
 		 685 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  34.82 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.17 
 
 		 541 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  34.82 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  35.24 
 
 		 540 aa  286  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  36.91 
 
 		 620 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  34.68 
 
 		 767 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.25 
 
 		 540 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  35.56 
 
 		 548 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  35.56 
 
 		 548 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  34.81 
 
 		 663 aa  283  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  34.55 
 
 		 560 aa  283  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  34.81 
 
 		 663 aa  282  9e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  34.62 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  34.24 
 
 		 540 aa  281  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  33.02 
 
 		 545 aa  279  9e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  33.27 
 
 		 637 aa  279  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.33 
 
 		 668 aa  279  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  34.77 
 
 		 540 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  33.52 
 
 		 639 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  34.77 
 
 		 548 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  34.06 
 
 		 540 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  32.75 
 
 		 638 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  34.06 
 
 		 540 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  33.83 
 
 		 540 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  33.81 
 
 		 659 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  32.74 
 
 		 643 aa  274  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  34.64 
 
 		 540 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  33.4 
 
 		 539 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  32.29 
 
 		 646 aa  273  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  33.07 
 
 		 540 aa  272  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 688 aa  270  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  33.14 
 
 		 645 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  33.85 
 
 		 540 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  34.03 
 
 		 544 aa  270  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  33.74 
 
 		 564 aa  269  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  33 
 
 		 540 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  31.83 
 
 		 634 aa  269  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  31.07 
 
 		 634 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  34.42 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  30.68 
 
 		 632 aa  268  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.03 
 
 		 543 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.72 
 
 		 645 aa  267  4e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  35.03 
 
 		 542 aa  266  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  34.37 
 
 		 656 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  30.83 
 
 		 544 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  33.01 
 
 		 635 aa  265  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  32.84 
 
 		 643 aa  265  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.03 
 
 		 709 aa  263  4.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  33.2 
 
 		 567 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 		 645 aa  263  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  34.79 
 
 		 540 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  34.6 
 
 		 540 aa  262  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  32.53 
 
 		 666 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  36.08 
 
 		 624 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  31.79 
 
 		 664 aa  261  3e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  33.27 
 
 		 659 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>