More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5134 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  71.77 
 
 		 533 aa  762    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21830  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  68.82 
 
 		 532 aa  722    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  68.27 
 
 		 537 aa  751    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3301  ABC transporter related  73.3 
 
 		 534 aa  745    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2204  ABC transporter related  69.56 
 
 		 537 aa  703    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  76.65 
 
 		 542 aa  831    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  66.05 
 
 		 532 aa  689    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  66.61 
 
 		 532 aa  722    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  65.56 
 
 		 532 aa  648    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.346167 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  67.16 
 
 		 532 aa  713    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2465  ABC transporter related protein  69.05 
 
 		 541 aa  719    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2238  ABC transporter related protein  68.82 
 
 		 532 aa  701    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000471653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2802  ABC transporter related protein  68.45 
 
 		 532 aa  702    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15491  normal  0.0601311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13460  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  64.64 
 
 		 532 aa  641    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.576158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5972  ABC transporter, ATP-binding protein  69.19 
 
 		 532 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.490457  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  68.63 
 
 		 532 aa  722    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  69.74 
 
 		 537 aa  706    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2483  ABC transporter related  77.94 
 
 		 542 aa  847    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  73.66 
 
 		 552 aa  748    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5134  ABC transporter related  100 
 
 		 542 aa  1083    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707972  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16300  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  83.95 
 
 		 542 aa  849    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  69.56 
 
 		 532 aa  723    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2446  ABC transporter related  77.94 
 
 		 542 aa  847    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1160  ABC transporter related  65.31 
 
 		 532 aa  670    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  75.18 
 
 		 542 aa  809    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  66.24 
 
 		 532 aa  716    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  69.37 
 
 		 532 aa  720    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2396  ABC transporter related protein  75.78 
 
 		 542 aa  809    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.647694  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  65.5 
 
 		 532 aa  691    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  61.88 
 
 		 534 aa  662    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2491  ABC transporter related  77.94 
 
 		 542 aa  847    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  77.02 
 
 		 563 aa  841    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  76.84 
 
 		 542 aa  830    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2326  ABC transporter related  69.74 
 
 		 532 aa  724    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386504  normal  0.590728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2289  ABC transporter related  78.6 
 
 		 541 aa  819    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000329331  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  59.29 
 
 		 533 aa  607  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 		 533 aa  588  1e-166  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  56.83 
 
 		 539 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  33.83 
 
 		 643 aa  318  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  35.7 
 
 		 545 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  34.32 
 
 		 540 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  34.69 
 
 		 540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  35.98 
 
 		 685 aa  307  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  34.32 
 
 		 540 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  34.32 
 
 		 540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  33.01 
 
 		 637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  34.93 
 
 		 540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  34.36 
 
 		 630 aa  305  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  37.16 
 
 		 620 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 663 aa  301  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  35.27 
 
 		 548 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  31.69 
 
 		 632 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 663 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  32.73 
 
 		 646 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  33.63 
 
 		 645 aa  300  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.42 
 
 		 668 aa  300  6e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  33.33 
 
 		 540 aa  300  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  37.13 
 
 		 567 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  35.08 
 
 		 548 aa  299  8e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.08 
 
 		 548 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  34.88 
 
 		 638 aa  298  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  33.39 
 
 		 540 aa  296  7e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  34.59 
 
 		 545 aa  296  8e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  34.94 
 
 		 653 aa  295  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  36.44 
 
 		 564 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.31 
 
 		 709 aa  293  4e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  33.64 
 
 		 540 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  33.09 
 
 		 540 aa  293  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  34.19 
 
 		 540 aa  293  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  33.64 
 
 		 540 aa  293  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.97 
 
 		 541 aa  292  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  34.56 
 
 		 656 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  34.35 
 
 		 690 aa  292  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  33.76 
 
 		 565 aa  292  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.88 
 
 		 543 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  31.82 
 
 		 544 aa  292  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  34.05 
 
 		 650 aa  291  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  33.15 
 
 		 540 aa  291  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  32.66 
 
 		 540 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  35.69 
 
 		 575 aa  289  9e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  33.45 
 
 		 641 aa  289  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  33.39 
 
 		 652 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  33.39 
 
 		 540 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  32.66 
 
 		 539 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  35.67 
 
 		 688 aa  287  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  33.58 
 
 		 560 aa  287  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  32.72 
 
 		 540 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  33.27 
 
 		 652 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  35.56 
 
 		 581 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  37.86 
 
 		 624 aa  286  8e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  34.64 
 
 		 672 aa  286  9e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 		 645 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 767 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  33.09 
 
 		 644 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  35.73 
 
 		 659 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  34.52 
 
 		 651 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  33.39 
 
 		 540 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  31.24 
 
 		 634 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 		 640 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 		 640 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>