More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1411 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 
533 aa  662    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13460  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  68.8 
 
 
532 aa  684    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.576158  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2204  ABC transporter related  65.92 
 
 
537 aa  636    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  65.6 
 
 
533 aa  687    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  69.17 
 
 
532 aa  713    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  68.98 
 
 
532 aa  727    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  64.02 
 
 
542 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16300  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  68.82 
 
 
542 aa  675    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2802  ABC transporter related protein  69.74 
 
 
532 aa  706    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15491  normal  0.0601311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  63.65 
 
 
542 aa  674    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  67.35 
 
 
533 aa  694    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21830  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  81.39 
 
 
532 aa  852    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2483  ABC transporter related  65.68 
 
 
542 aa  689    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2465  ABC transporter related protein  66.36 
 
 
541 aa  660    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0270517  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  66.29 
 
 
537 aa  639    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  64.76 
 
 
542 aa  680    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3301  ABC transporter related  66.67 
 
 
534 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2326  ABC transporter related  77.82 
 
 
532 aa  796    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386504  normal  0.590728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2446  ABC transporter related  65.68 
 
 
542 aa  689    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  66.91 
 
 
552 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  73.12 
 
 
532 aa  753    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  66.23 
 
 
534 aa  699    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  66.73 
 
 
532 aa  649    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.346167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  78.01 
 
 
532 aa  806    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2238  ABC transporter related protein  68.98 
 
 
532 aa  692    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000471653  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1160  ABC transporter related  77.82 
 
 
532 aa  806    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2289  ABC transporter related  66.54 
 
 
541 aa  665    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000329331  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  68.42 
 
 
532 aa  718    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5972  ABC transporter, ATP-binding protein  69.55 
 
 
532 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.490457  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  100 
 
 
532 aa  1068    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  71.43 
 
 
537 aa  763    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  70.11 
 
 
532 aa  739    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2491  ABC transporter related  65.68 
 
 
542 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11427  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  64.76 
 
 
563 aa  685    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.676431 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  70.49 
 
 
532 aa  741    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2396  ABC transporter related protein  64.21 
 
 
542 aa  659    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.647694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5134  ABC transporter related  69.56 
 
 
542 aa  715    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707972  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  62.04 
 
 
539 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 
540 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  35.91 
 
 
630 aa  328  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  36.64 
 
 
540 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  36.64 
 
 
540 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  34.33 
 
 
637 aa  326  5e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  36.64 
 
 
540 aa  325  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  37.15 
 
 
638 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 
632 aa  322  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.01 
 
 
541 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  37.07 
 
 
540 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  35.57 
 
 
540 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  35.07 
 
 
540 aa  320  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  34.26 
 
 
643 aa  319  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  36.9 
 
 
545 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  35.38 
 
 
540 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  35.89 
 
 
540 aa  315  9e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  35.67 
 
 
540 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  35.86 
 
 
668 aa  313  4.999999999999999e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
767 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  35.87 
 
 
560 aa  309  9e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  34.55 
 
 
540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  34.89 
 
 
540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
688 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  37.09 
 
 
565 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  35.07 
 
 
540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  35.44 
 
 
540 aa  307  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  36.72 
 
 
685 aa  307  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  35.33 
 
 
540 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  35.66 
 
 
653 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.79 
 
 
548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  34.27 
 
 
539 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  37.5 
 
 
659 aa  303  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 
663 aa  303  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  36.72 
 
 
663 aa  302  1e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  35.69 
 
 
641 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  35.24 
 
 
548 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  35.35 
 
 
650 aa  300  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  35.06 
 
 
548 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  35.28 
 
 
646 aa  300  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  33.47 
 
 
634 aa  299  8e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.92 
 
 
709 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  33.91 
 
 
544 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  34.68 
 
 
543 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  35.6 
 
 
544 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  34.78 
 
 
652 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  36.03 
 
 
549 aa  296  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  35.25 
 
 
540 aa  296  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  35.22 
 
 
564 aa  296  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  32.75 
 
 
634 aa  296  8e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  35.96 
 
 
540 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  36.38 
 
 
540 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  35.42 
 
 
672 aa  295  1e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  34.3 
 
 
651 aa  294  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  40.48 
 
 
642 aa  295  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.05 
 
 
645 aa  294  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  34.63 
 
 
644 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  35.78 
 
 
542 aa  294  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  35.69 
 
 
535 aa  293  4e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 
650 aa  293  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  35.93 
 
 
567 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
545 aa  293  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  35.02 
 
 
620 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>