More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1276 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1341  ABC transporter ATP-binding protein  98.6 
 
 
645 aa  1289    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3138  ABC transporter related  75.58 
 
 
621 aa  925    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00577211  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  74.92 
 
 
630 aa  932    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1276  ABC transporter related  100 
 
 
645 aa  1310    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  45.92 
 
 
641 aa  551  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  45.94 
 
 
633 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  47.45 
 
 
636 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  44.46 
 
 
636 aa  545  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 
634 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 
635 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  46.94 
 
 
624 aa  538  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  46.24 
 
 
635 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  47.84 
 
 
636 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  47.02 
 
 
635 aa  534  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  46.66 
 
 
643 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.43 
 
 
637 aa  535  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  47.46 
 
 
636 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  46.72 
 
 
648 aa  534  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  45.71 
 
 
640 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.48 
 
 
637 aa  533  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.32 
 
 
637 aa  531  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.32 
 
 
637 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  44.32 
 
 
637 aa  531  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  47.22 
 
 
651 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.32 
 
 
637 aa  531  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.32 
 
 
637 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  47.52 
 
 
636 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.32 
 
 
637 aa  531  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  44.32 
 
 
637 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.32 
 
 
637 aa  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  45.09 
 
 
636 aa  528  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 
636 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 
635 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  47.52 
 
 
636 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 
635 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  47.06 
 
 
636 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.44 
 
 
635 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  47.44 
 
 
633 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 
638 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.23 
 
 
635 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.07 
 
 
635 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
637 aa  521  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  45.41 
 
 
637 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  45.57 
 
 
637 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  47.68 
 
 
638 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  51.9 
 
 
642 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  45.57 
 
 
637 aa  522  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 
639 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  45.8 
 
 
650 aa  519  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.91 
 
 
635 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  45.57 
 
 
637 aa  522  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  45.41 
 
 
636 aa  521  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 
635 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  44.88 
 
 
656 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  45.44 
 
 
637 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  44.05 
 
 
636 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  45.29 
 
 
637 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  45.29 
 
 
637 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.99 
 
 
638 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  44.31 
 
 
657 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 
640 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  46.2 
 
 
645 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 
640 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 
640 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0220  ABC transporter related  47.68 
 
 
615 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  45.84 
 
 
643 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  44.53 
 
 
636 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0433  ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 
641 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1830  hypothetical protein  43.3 
 
 
616 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1833  hypothetical protein  43.3 
 
 
616 aa  508  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.05 
 
 
634 aa  505  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  45.9 
 
 
692 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  44.2 
 
 
659 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 
637 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  46.02 
 
 
676 aa  504  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0581  ABC transporter related  45.44 
 
 
647 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  44.22 
 
 
646 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  47.28 
 
 
646 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 
657 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
646 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  43.62 
 
 
639 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
638 aa  498  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
646 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
646 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
646 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
646 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2338  ABC transporter related protein  45.58 
 
 
635 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
646 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5345  ABC transporter, fused ATPase subunits  45.26 
 
 
643 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2010  ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 
646 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1759  ABC transporter-related protein  46.62 
 
 
554 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.656937  normal  0.0503302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3608  ABC transporter related  48.54 
 
 
687 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100909  normal  0.0123712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2055  ABC transporter related  45.41 
 
 
643 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.035925  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
643 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6041  ABC transporter related  45.41 
 
 
643 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  44.13 
 
 
650 aa  490  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2036  ABC transporter related  45.41 
 
 
643 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252943  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  45.37 
 
 
650 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  46.33 
 
 
672 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2068  ABC transporter related  45.26 
 
 
643 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>