More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5678 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  86.44 
 
 
548 aa  928    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  64.58 
 
 
555 aa  664    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  79.75 
 
 
554 aa  818    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  100 
 
 
553 aa  1095    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  72.51 
 
 
553 aa  764    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  85.87 
 
 
550 aa  920    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  75.59 
 
 
550 aa  818    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  100 
 
 
553 aa  1095    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  100 
 
 
553 aa  1095    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  73.37 
 
 
569 aa  770    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  60.58 
 
 
545 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  61.23 
 
 
542 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  60.04 
 
 
545 aa  617  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  62.39 
 
 
544 aa  610  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  60.87 
 
 
544 aa  579  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0053  ABC transporter related protein  60.4 
 
 
548 aa  561  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00894848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  59.5 
 
 
549 aa  561  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  53.95 
 
 
537 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  52.88 
 
 
551 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  49.91 
 
 
537 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.67 
 
 
634 aa  280  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
552 aa  279  8e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
543 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.01 
 
 
575 aa  273  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  35.35 
 
 
544 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  34.21 
 
 
581 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  33.39 
 
 
549 aa  265  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  35.43 
 
 
567 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.81 
 
 
668 aa  264  3e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  33.09 
 
 
543 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.93 
 
 
543 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  32.77 
 
 
564 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  34.35 
 
 
540 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.33 
 
 
709 aa  261  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  33.99 
 
 
540 aa  259  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  33.77 
 
 
641 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 
545 aa  257  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  33.9 
 
 
564 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  32.58 
 
 
540 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  33.45 
 
 
542 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  31.24 
 
 
630 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 
662 aa  250  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31 
 
 
644 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  34.45 
 
 
659 aa  250  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 
644 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.93 
 
 
579 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.74 
 
 
554 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  32.73 
 
 
636 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.14 
 
 
659 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 
658 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 
658 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.2 
 
 
658 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.2 
 
 
640 aa  248  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.02 
 
 
644 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  34.21 
 
 
560 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 
658 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.71 
 
 
548 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  34.1 
 
 
569 aa  246  6e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.17 
 
 
639 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.21 
 
 
548 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  32.89 
 
 
540 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  29.39 
 
 
642 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  29.39 
 
 
642 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  30.84 
 
 
658 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.39 
 
 
659 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  36.48 
 
 
649 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.33 
 
 
548 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 
555 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  35.19 
 
 
539 aa  244  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  33.15 
 
 
540 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  33.27 
 
 
767 aa  243  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.57 
 
 
690 aa  243  5e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  35 
 
 
574 aa  243  6e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 
555 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  36.11 
 
 
641 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 
555 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.73 
 
 
672 aa  243  7.999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.38 
 
 
555 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  28.28 
 
 
536 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  36.3 
 
 
649 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  31.34 
 
 
545 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  30.64 
 
 
645 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  28.75 
 
 
540 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  29.14 
 
 
632 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2900  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 
554 aa  241  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196259 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.87 
 
 
636 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  34.51 
 
 
574 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 
648 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.33 
 
 
556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.53 
 
 
540 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  35.54 
 
 
648 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  28.62 
 
 
541 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
517 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.65 
 
 
554 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  30.02 
 
 
685 aa  239  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  31 
 
 
638 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  29.72 
 
 
636 aa  238  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2686  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 
549 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530992  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  32.9 
 
 
630 aa  238  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.08 
 
 
554 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>