More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4909 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  100 
 
 		 551 aa  1066    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  73.03 
 
 		 537 aa  733    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  60.11 
 
 		 542 aa  594  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  58.47 
 
 		 545 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  58.11 
 
 		 545 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  55.38 
 
 		 555 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  56.47 
 
 		 544 aa  524  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  54.23 
 
 		 569 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  53.75 
 
 		 553 aa  510  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  52.96 
 
 		 550 aa  507  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0053  ABC transporter related protein  58.95 
 
 		 548 aa  505  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  54.71 
 
 		 548 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  57.87 
 
 		 544 aa  502  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  55.15 
 
 		 550 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  52.96 
 
 		 553 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  52.96 
 
 		 553 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  52.96 
 
 		 553 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  54.15 
 
 		 549 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  52.32 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  51.29 
 
 		 537 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  42.42 
 
 		 543 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  32.73 
 
 		 552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.59 
 
 		 672 aa  246  9e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.91 
 
 		 668 aa  242  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 644 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 636 aa  240  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.41 
 
 		 634 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.52 
 
 		 709 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  30.85 
 
 		 659 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 658 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  30.85 
 
 		 644 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  32.92 
 
 		 540 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  30.97 
 
 		 658 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  30.95 
 
 		 659 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  30.78 
 
 		 658 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  30.78 
 
 		 640 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  30.78 
 
 		 658 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  33.4 
 
 		 620 aa  232  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  30.42 
 
 		 658 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  30.6 
 
 		 662 aa  229  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  31.63 
 
 		 564 aa  229  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  30.59 
 
 		 644 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  32.56 
 
 		 540 aa  229  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  29.95 
 
 		 644 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 		 545 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  29.61 
 
 		 627 aa  226  6e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.21 
 
 		 634 aa  226  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 		 517 aa  225  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  30.73 
 
 		 575 aa  225  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  32.43 
 
 		 658 aa  225  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  33.52 
 
 		 569 aa  224  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  33.4 
 
 		 540 aa  224  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  33.4 
 
 		 540 aa  223  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  30.52 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.02 
 
 		 540 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  30.52 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.31 
 
 		 641 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  30.34 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.57 
 
 		 690 aa  221  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  30.34 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  31.37 
 
 		 544 aa  220  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  30.21 
 
 		 517 aa  220  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  31.41 
 
 		 543 aa  220  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  32.52 
 
 		 567 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  28.28 
 
 		 642 aa  219  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  28.28 
 
 		 642 aa  219  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  29.76 
 
 		 581 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  29.24 
 
 		 517 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  30.52 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  28.36 
 
 		 632 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  29.78 
 
 		 630 aa  219  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5556  ABC transporter, ATP-binding protein  30.52 
 
 		 517 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  30.52 
 
 		 530 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5614  ABC transporter ATP-binding protein uup  30.49 
 
 		 517 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  31.04 
 
 		 547 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.16 
 
 		 644 aa  217  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  29.21 
 
 		 640 aa  217  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  28.7 
 
 		 646 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  32.58 
 
 		 659 aa  217  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  32.5 
 
 		 649 aa  217  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  35.45 
 
 		 537 aa  216  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  30.14 
 
 		 543 aa  216  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  30.71 
 
 		 542 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  31.06 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  33.07 
 
 		 545 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  28.67 
 
 		 641 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  29.7 
 
 		 666 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  36.75 
 
 		 563 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  29.89 
 
 		 649 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  33.52 
 
 		 548 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.15 
 
 		 640 aa  213  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  31.63 
 
 		 564 aa  213  7e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.15 
 
 		 640 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  30.5 
 
 		 545 aa  213  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.96 
 
 		 640 aa  213  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  33.4 
 
 		 632 aa  212  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  33.33 
 
 		 548 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  33.02 
 
 		 548 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  34.36 
 
 		 645 aa  210  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.06 
 
 		 636 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>