More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2670 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  73.03 
 
 		 551 aa  732    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  100 
 
 		 537 aa  1050    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  59.62 
 
 		 542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  59.47 
 
 		 545 aa  568  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  59.92 
 
 		 545 aa  564  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  59.92 
 
 		 544 aa  541  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  55.99 
 
 		 550 aa  524  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  56.23 
 
 		 569 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  55.76 
 
 		 555 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  60.68 
 
 		 544 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  55.64 
 
 		 548 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  54.06 
 
 		 553 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  55.45 
 
 		 550 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0053  ABC transporter related protein  58.6 
 
 		 548 aa  493  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  54.32 
 
 		 553 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  54.32 
 
 		 553 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  54.32 
 
 		 553 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  55.02 
 
 		 549 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  53.26 
 
 		 537 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  54.12 
 
 		 554 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  40.49 
 
 		 543 aa  290  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  34.2 
 
 		 552 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  34.3 
 
 		 620 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  34.33 
 
 		 540 aa  236  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  34.33 
 
 		 540 aa  236  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  34.71 
 
 		 540 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.93 
 
 		 548 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.85 
 
 		 634 aa  230  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  30.38 
 
 		 672 aa  229  7e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  31.57 
 
 		 658 aa  229  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  32.53 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.74 
 
 		 548 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.01 
 
 		 548 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 		 644 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.57 
 
 		 658 aa  228  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  32.77 
 
 		 540 aa  228  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 659 aa  228  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.38 
 
 		 658 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  32.5 
 
 		 560 aa  227  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  30.96 
 
 		 644 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  37.28 
 
 		 632 aa  227  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 		 662 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.38 
 
 		 658 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  30.38 
 
 		 581 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.38 
 
 		 658 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.23 
 
 		 640 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  32.58 
 
 		 540 aa  226  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  32.41 
 
 		 540 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.38 
 
 		 659 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30.99 
 
 		 636 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  34.59 
 
 		 545 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  33.09 
 
 		 540 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  30.93 
 
 		 641 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  34.54 
 
 		 659 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  32.9 
 
 		 540 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 545 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  29.34 
 
 		 644 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  32.23 
 
 		 540 aa  217  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  32.66 
 
 		 540 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  32.96 
 
 		 539 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.45 
 
 		 709 aa  216  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  31.85 
 
 		 636 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.53 
 
 		 668 aa  216  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  31.13 
 
 		 564 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.06 
 
 		 690 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  30.31 
 
 		 640 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  31.99 
 
 		 540 aa  213  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  31.73 
 
 		 540 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.4 
 
 		 634 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  31.35 
 
 		 545 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  32.7 
 
 		 644 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  29.78 
 
 		 543 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  30.15 
 
 		 543 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  30.62 
 
 		 575 aa  210  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  31.56 
 
 		 567 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  29.65 
 
 		 645 aa  209  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  32.69 
 
 		 565 aa  209  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  31.29 
 
 		 569 aa  209  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  28.82 
 
 		 517 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  29.01 
 
 		 517 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  28.82 
 
 		 517 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  28.82 
 
 		 517 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  32.04 
 
 		 540 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.11 
 
 		 541 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  28.82 
 
 		 517 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  28.82 
 
 		 517 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  33.15 
 
 		 540 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  32.57 
 
 		 540 aa  207  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  33.02 
 
 		 659 aa  206  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  30.91 
 
 		 544 aa  206  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  28.63 
 
 		 517 aa  206  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  32.95 
 
 		 540 aa  206  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  29.58 
 
 		 666 aa  206  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  30.02 
 
 		 635 aa  206  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 		 530 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  30.65 
 
 		 638 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  30.89 
 
 		 547 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  31.56 
 
 		 767 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.27 
 
 		 643 aa  205  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5614  ABC transporter ATP-binding protein uup  28.63 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>