More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0995 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  79.75 
 
 
554 aa  817    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  85.87 
 
 
553 aa  917    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  75.27 
 
 
550 aa  808    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  62.23 
 
 
545 aa  638    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  71.9 
 
 
553 aa  754    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  85.87 
 
 
553 aa  917    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  100 
 
 
550 aa  1090    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  64.45 
 
 
555 aa  668    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  72.81 
 
 
569 aa  760    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  85.87 
 
 
553 aa  917    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  88.67 
 
 
548 aa  927    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  61.38 
 
 
545 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  62.52 
 
 
542 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  63.14 
 
 
544 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  62.41 
 
 
544 aa  588  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  59.71 
 
 
549 aa  564  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0053  ABC transporter related protein  60.73 
 
 
548 aa  553  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00894848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  55.15 
 
 
551 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  55.45 
 
 
537 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  49.91 
 
 
537 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  41.42 
 
 
543 aa  281  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  33.52 
 
 
575 aa  268  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.9 
 
 
634 aa  262  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  34.91 
 
 
564 aa  260  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  33.59 
 
 
581 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 
545 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  35.24 
 
 
567 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  33.82 
 
 
544 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  34 
 
 
543 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.59 
 
 
709 aa  251  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  33.63 
 
 
540 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  33.57 
 
 
540 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  32.73 
 
 
552 aa  251  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  34.61 
 
 
564 aa  249  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.07 
 
 
668 aa  248  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.17 
 
 
643 aa  249  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.73 
 
 
672 aa  248  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  32.19 
 
 
543 aa  246  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  36.06 
 
 
641 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  33.99 
 
 
549 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  34.15 
 
 
659 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.42 
 
 
548 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  33.82 
 
 
542 aa  243  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  32.65 
 
 
540 aa  243  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  33.82 
 
 
630 aa  242  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  34.93 
 
 
574 aa  240  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  28.12 
 
 
540 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.46 
 
 
548 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.78 
 
 
639 aa  238  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  30.88 
 
 
645 aa  238  3e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  29.34 
 
 
541 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
660 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
660 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  30.24 
 
 
685 aa  236  6e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  33.46 
 
 
560 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  27.83 
 
 
536 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.27 
 
 
548 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
648 aa  236  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  31.51 
 
 
640 aa  236  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  34.43 
 
 
632 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  34.27 
 
 
574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 
648 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 
648 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  30.78 
 
 
572 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  34.67 
 
 
569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  34.84 
 
 
640 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  28.81 
 
 
541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  30.78 
 
 
545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 
648 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 
660 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  34.2 
 
 
648 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  30.78 
 
 
572 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 
636 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  32.58 
 
 
767 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.17 
 
 
641 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.69 
 
 
634 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  30.45 
 
 
659 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  29.7 
 
 
642 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 
662 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  31.65 
 
 
632 aa  232  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 
644 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  29.7 
 
 
642 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.4 
 
 
644 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  30.37 
 
 
630 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  34.5 
 
 
545 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 
1065 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  33.09 
 
 
540 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  34.63 
 
 
645 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  29.96 
 
 
658 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  34.88 
 
 
649 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 
644 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  30.59 
 
 
663 aa  231  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  30.59 
 
 
663 aa  231  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.67 
 
 
636 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 
658 aa  230  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  31.4 
 
 
879 aa  230  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  32.47 
 
 
629 aa  230  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  30.15 
 
 
658 aa  229  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  34.88 
 
 
649 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  30.15 
 
 
658 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>