More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0452 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  70.83 
 
 		 545 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  72.88 
 
 		 542 aa  734    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  67.64 
 
 		 549 aa  639    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  65.76 
 
 		 550 aa  671    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  72.84 
 
 		 545 aa  776    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  100 
 
 		 544 aa  1060    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  68.07 
 
 		 553 aa  686    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  71.88 
 
 		 544 aa  682    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  70.29 
 
 		 555 aa  731    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  68.01 
 
 		 569 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  64.85 
 
 		 548 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0053  ABC transporter related protein  69.17 
 
 		 548 aa  634  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  63.14 
 
 		 550 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  62.39 
 
 		 553 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  62.39 
 
 		 553 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  62.39 
 
 		 553 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  62.03 
 
 		 554 aa  593  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  59.92 
 
 		 537 aa  548  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  56.47 
 
 		 551 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  52.33 
 
 		 537 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  41.62 
 
 		 543 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  35.82 
 
 		 567 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  33.58 
 
 		 581 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 552 aa  273  7e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.81 
 
 		 575 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  34.43 
 
 		 564 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  34.84 
 
 		 564 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  31.65 
 
 		 634 aa  264  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  35.1 
 
 		 569 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  33.93 
 
 		 540 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  34.35 
 
 		 636 aa  250  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  33.99 
 
 		 540 aa  249  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  32.12 
 
 		 640 aa  249  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  30.98 
 
 		 630 aa  247  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  35.78 
 
 		 545 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  33.39 
 
 		 672 aa  246  4.9999999999999997e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  33.39 
 
 		 543 aa  246  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.64 
 
 		 540 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  32.62 
 
 		 543 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  33.7 
 
 		 545 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.15 
 
 		 709 aa  245  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  34.39 
 
 		 560 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  35.09 
 
 		 548 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  28.6 
 
 		 536 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.37 
 
 		 668 aa  243  9e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.73 
 
 		 549 aa  242  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.91 
 
 		 548 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  30.4 
 
 		 572 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  35.87 
 
 		 540 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  28.42 
 
 		 541 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  36.2 
 
 		 649 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  30.95 
 
 		 572 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  30 
 
 		 639 aa  240  5e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  34.53 
 
 		 548 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  33.21 
 
 		 630 aa  239  8e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  34.14 
 
 		 540 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  36.01 
 
 		 649 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  29.4 
 
 		 544 aa  238  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  35.01 
 
 		 574 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  33.21 
 
 		 540 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  36.05 
 
 		 688 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  32.39 
 
 		 544 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  33.03 
 
 		 542 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  35.99 
 
 		 661 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  35.99 
 
 		 661 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  28.23 
 
 		 541 aa  236  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  34.64 
 
 		 540 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  33.02 
 
 		 540 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  36.36 
 
 		 649 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  34.64 
 
 		 540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  34.64 
 
 		 540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  29.96 
 
 		 540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  35.8 
 
 		 649 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  34.29 
 
 		 659 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.73 
 
 		 643 aa  234  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  32.5 
 
 		 632 aa  233  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  34.48 
 
 		 632 aa  233  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  32.4 
 
 		 540 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  33.76 
 
 		 540 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  33.21 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  31.04 
 
 		 666 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 644 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  34.51 
 
 		 574 aa  231  3e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  35.92 
 
 		 632 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 644 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  30.55 
 
 		 658 aa  231  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  31.47 
 
 		 685 aa  231  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  37.12 
 
 		 632 aa  231  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 662 aa  230  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.52 
 
 		 690 aa  229  7e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 629 aa  229  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 		 648 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  33.21 
 
 		 540 aa  229  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.42 
 
 		 539 aa  229  9e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 659 aa  229  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  30.55 
 
 		 658 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 658 aa  229  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  34.14 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  30.36 
 
 		 658 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  30.36 
 
 		 640 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>