More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1055 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  72.88 
 
 
544 aa  708    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  78.49 
 
 
545 aa  832    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  75.92 
 
 
545 aa  795    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  67.83 
 
 
549 aa  650    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  73.71 
 
 
544 aa  708    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  68.17 
 
 
555 aa  687    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0053  ABC transporter related protein  68.38 
 
 
548 aa  640    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00894848 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  64 
 
 
550 aa  652    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  64.59 
 
 
569 aa  643    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  100 
 
 
542 aa  1051    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  63.1 
 
 
553 aa  627  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  61.23 
 
 
553 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  61.23 
 
 
553 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  61.23 
 
 
553 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  62.77 
 
 
548 aa  611  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  62.52 
 
 
550 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  61.44 
 
 
554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  60.11 
 
 
551 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  59.62 
 
 
537 aa  560  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  53.89 
 
 
537 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  44.2 
 
 
543 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  34.06 
 
 
552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  36.52 
 
 
575 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  35.34 
 
 
581 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  32.09 
 
 
634 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  36.56 
 
 
569 aa  259  9e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  36.76 
 
 
567 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  33.21 
 
 
658 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  33.76 
 
 
659 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  36.43 
 
 
564 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  35.81 
 
 
620 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
644 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  33.83 
 
 
545 aa  246  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 
662 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
658 aa  246  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 
658 aa  246  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  32.84 
 
 
658 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  34.2 
 
 
672 aa  246  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 
658 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  33.39 
 
 
644 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 
659 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
540 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  32.84 
 
 
640 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  33.33 
 
 
540 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  35.89 
 
 
564 aa  243  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  31.8 
 
 
630 aa  243  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  33.52 
 
 
540 aa  242  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  33.52 
 
 
540 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  32.91 
 
 
636 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  31 
 
 
666 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  32.45 
 
 
572 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.58 
 
 
548 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  36.17 
 
 
574 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.21 
 
 
540 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  30.81 
 
 
540 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.58 
 
 
548 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.33 
 
 
543 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  34.02 
 
 
548 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  32.03 
 
 
572 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.27 
 
 
709 aa  236  6e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  31.91 
 
 
640 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  32.3 
 
 
543 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.07 
 
 
643 aa  234  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  33.71 
 
 
575 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  33.03 
 
 
544 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  32.59 
 
 
540 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  35.04 
 
 
661 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.75 
 
 
634 aa  231  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  35.04 
 
 
661 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  32.45 
 
 
540 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  31.47 
 
 
663 aa  230  6e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  35.69 
 
 
649 aa  230  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  32.53 
 
 
560 aa  230  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  34.17 
 
 
767 aa  229  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  34.85 
 
 
649 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  29.74 
 
 
632 aa  229  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  31.77 
 
 
517 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  31.54 
 
 
663 aa  229  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.21 
 
 
639 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  33.77 
 
 
545 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  35.06 
 
 
649 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  33.69 
 
 
667 aa  228  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  34.81 
 
 
645 aa  227  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  32.22 
 
 
540 aa  227  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  28.84 
 
 
536 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  30.73 
 
 
545 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  30.95 
 
 
685 aa  226  7e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  34.81 
 
 
648 aa  226  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  32.66 
 
 
637 aa  226  9e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  31.9 
 
 
517 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  35.48 
 
 
688 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  32.91 
 
 
658 aa  225  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  31.55 
 
 
547 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  28.05 
 
 
541 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  31.78 
 
 
540 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  28.39 
 
 
541 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.78 
 
 
644 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.48 
 
 
668 aa  224  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  31.78 
 
 
517 aa  224  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  33.09 
 
 
542 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>