More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2616 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  68.03 
 
 		 566 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  100 
 
 		 540 aa  1020    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 562 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  52.06 
 
 		 600 aa  476  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  52.63 
 
 		 548 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  49.05 
 
 		 509 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.047738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  46.13 
 
 		 553 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  45.26 
 
 		 548 aa  345  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  44.77 
 
 		 552 aa  343  5.999999999999999e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  39.09 
 
 		 554 aa  311  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  40.55 
 
 		 537 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  39.7 
 
 		 564 aa  252  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  38.08 
 
 		 561 aa  224  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  36.08 
 
 		 563 aa  223  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1063  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 671 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.89 
 
 		 585 aa  220  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  38.84 
 
 		 536 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 546 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  37.96 
 
 		 563 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  31.28 
 
 		 547 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.12 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.76 
 
 		 583 aa  195  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 543 aa  193  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  38.45 
 
 		 550 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  40.27 
 
 		 563 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  36.18 
 
 		 542 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  35.08 
 
 		 551 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  38.96 
 
 		 551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  29.71 
 
 		 644 aa  184  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 551 aa  183  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  33.46 
 
 		 545 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  34.18 
 
 		 544 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  34.6 
 
 		 569 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 		 627 aa  181  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.31 
 
 		 550 aa  181  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  33.64 
 
 		 541 aa  180  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  31.48 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.75 
 
 		 532 aa  178  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 542 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  29.85 
 
 		 627 aa  179  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  29.85 
 
 		 630 aa  179  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  31.01 
 
 		 640 aa  178  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  29.93 
 
 		 631 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  31.73 
 
 		 624 aa  177  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  32.07 
 
 		 532 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  32.63 
 
 		 625 aa  177  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  33.27 
 
 		 532 aa  176  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2238  ABC transporter related protein  33.59 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000471653  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  34.24 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  32.71 
 
 		 537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  31.94 
 
 		 625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.5 
 
 		 551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  28.11 
 
 		 636 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  28.73 
 
 		 654 aa  174  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  28.57 
 
 		 636 aa  174  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  27.6 
 
 		 643 aa  174  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  27.02 
 
 		 643 aa  174  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  32.25 
 
 		 625 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  31.86 
 
 		 532 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  34.51 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.8 
 
 		 534 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  34.51 
 
 		 554 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  34.19 
 
 		 542 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  30.06 
 
 		 690 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  32.64 
 
 		 645 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  29.14 
 
 		 532 aa  172  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.72 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  29.14 
 
 		 532 aa  172  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  30.52 
 
 		 663 aa  172  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.76 
 
 		 560 aa  171  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.51 
 
 		 709 aa  171  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  33.15 
 
 		 537 aa  171  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  26.97 
 
 		 643 aa  171  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  30.69 
 
 		 634 aa  170  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  32.33 
 
 		 622 aa  170  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 		 663 aa  170  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.79 
 
 		 640 aa  169  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  28.12 
 
 		 641 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.77 
 
 		 559 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.38 
 
 		 559 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  30.17 
 
 		 685 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.38 
 
 		 559 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.79 
 
 		 640 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.79 
 
 		 640 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  32.69 
 
 		 648 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  31.69 
 
 		 635 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 		 559 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  26.42 
 
 		 535 aa  169  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  32.12 
 
 		 625 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  31.67 
 
 		 532 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 555 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  28.84 
 
 		 635 aa  168  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  29.8 
 
 		 668 aa  168  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  32.58 
 
 		 532 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0967  ABC transporter, ATP-binding protein  26.37 
 
 		 643 aa  168  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.34 
 
 		 551 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.67 
 
 		 635 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.45 
 
 		 560 aa  167  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.89 
 
 		 635 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.89 
 
 		 635 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>