More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1527 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  60.54 
 
 		 555 aa  682    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  60.54 
 
 		 555 aa  682    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.73 
 
 		 559 aa  751    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.98 
 
 		 555 aa  699    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2608  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.94 
 
 		 579 aa  677    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.234433  normal  0.107182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4758  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.03 
 
 		 553 aa  687    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.06 
 
 		 555 aa  777    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.8 
 
 		 555 aa  709    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.34 
 
 		 555 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.04 
 
 		 559 aa  677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.73 
 
 		 549 aa  775    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3472  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.54 
 
 		 555 aa  681    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  61.12 
 
 		 563 aa  689    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.68 
 
 		 584 aa  773    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1183  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.65 
 
 		 554 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.976373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.2 
 
 		 561 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.34 
 
 		 555 aa  712    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.64 
 
 		 557 aa  744    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  63 
 
 		 557 aa  748    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.19 
 
 		 554 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.11 
 
 		 553 aa  682    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 		 554 aa  689    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 		 547 aa  664    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.58 
 
 		 551 aa  769    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.8 
 
 		 555 aa  709    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 		 595 aa  715    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.29 
 
 		 550 aa  773    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.19 
 
 		 551 aa  778    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.34 
 
 		 555 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.37 
 
 		 557 aa  768    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.19 
 
 		 554 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.19 
 
 		 551 aa  778    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.96 
 
 		 561 aa  747    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.34 
 
 		 555 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.57 
 
 		 549 aa  765    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.82 
 
 		 558 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3163  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 		 555 aa  670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0552  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.08 
 
 		 555 aa  687    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.83 
 
 		 559 aa  743    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2781  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 		 555 aa  679    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.957442  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 561 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.73 
 
 		 556 aa  758    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.34 
 
 		 555 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.62 
 
 		 554 aa  701    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.64 
 
 		 556 aa  744    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 559 aa  1140    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.62 
 
 		 555 aa  706    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.73 
 
 		 554 aa  697    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.61 
 
 		 560 aa  670    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.11 
 
 		 549 aa  763    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.29 
 
 		 559 aa  756    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.4 
 
 		 551 aa  748    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.21 
 
 		 553 aa  701    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.58 
 
 		 553 aa  684    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.85 
 
 		 549 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3519  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.03 
 
 		 553 aa  690    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.876019  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.08 
 
 		 555 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1141  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.9 
 
 		 555 aa  678    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776403  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.39 
 
 		 549 aa  758    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.34 
 
 		 555 aa  712    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 		 578 aa  685    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.21 
 
 		 550 aa  766    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.11 
 
 		 553 aa  682    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1245  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.12 
 
 		 553 aa  678    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.34 
 
 		 589 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.04 
 
 		 555 aa  750    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.17 
 
 		 670 aa  787    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 		 705 aa  717    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 		 555 aa  673    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1296  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 		 555 aa  675    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341182  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.21 
 
 		 549 aa  754    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.4 
 
 		 556 aa  709    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.34 
 
 		 555 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2084  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.37 
 
 		 555 aa  698    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.695655  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.58 
 
 		 556 aa  692    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.52 
 
 		 555 aa  705    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 		 555 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.53945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1159  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 		 555 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.99 
 
 		 555 aa  783    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1032  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 		 555 aa  672    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.07 
 
 		 555 aa  767    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.8 
 
 		 555 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.91 
 
 		 554 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 		 555 aa  716    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.62 
 
 		 561 aa  727    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.61 
 
 		 560 aa  768    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 		 555 aa  682    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.61 
 
 		 556 aa  670    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.65 
 
 		 559 aa  731    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.52 
 
 		 555 aa  711    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.01 
 
 		 551 aa  775    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.37 
 
 		 563 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1013  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.54 
 
 		 555 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.84 
 
 		 559 aa  818    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1437  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.21 
 
 		 554 aa  660    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 		 557 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.73 
 
 		 553 aa  691    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 		 560 aa  687    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1801  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.93 
 
 		 553 aa  697    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.124805  normal  0.0665876 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.86 
 
 		 549 aa  714    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>