More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3542 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.22 
 
 		 560 aa  861    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.49 
 
 		 554 aa  893    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.12 
 
 		 559 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.11 
 
 		 555 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 		 555 aa  682    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.39 
 
 		 555 aa  672    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1384  ABC transporter related protein  74.37 
 
 		 557 aa  840    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.8 
 
 		 549 aa  665    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.63 
 
 		 558 aa  770    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 558 aa  1140    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 561 aa  657    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.6 
 
 		 558 aa  890    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1352  ABC transporter related protein  77.9 
 
 		 560 aa  859    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000271939  hitchhiker  0.0000279927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 557 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 557 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.57 
 
 		 554 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1089  ABC transporter related protein  77.54 
 
 		 560 aa  878    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.27 
 
 		 550 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.5 
 
 		 547 aa  860    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  73.98 
 
 		 556 aa  836    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.96 
 
 		 557 aa  875    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  75.81 
 
 		 557 aa  853    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.71 
 
 		 559 aa  799    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.79 
 
 		 550 aa  650    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.21 
 
 		 554 aa  652    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.82 
 
 		 557 aa  666    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  57.68 
 
 		 555 aa  646    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.99 
 
 		 551 aa  671    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 561 aa  652    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.64 
 
 		 558 aa  889    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 558 aa  653    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.15 
 
 		 560 aa  841    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3426  ABC transporter related protein  78.67 
 
 		 554 aa  884    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.66 
 
 		 559 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.11 
 
 		 555 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.05 
 
 		 559 aa  794    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.65 
 
 		 556 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.83 
 
 		 559 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  79.21 
 
 		 554 aa  906    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.82 
 
 		 559 aa  671    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.45 
 
 		 551 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.47 
 
 		 558 aa  923    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0931  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.18 
 
 		 560 aa  876    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.87 
 
 		 560 aa  848    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 		 549 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.9 
 
 		 559 aa  641    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 		 551 aa  652    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1002  ABC transporter related protein  62.84 
 
 		 551 aa  669    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  98.39 
 
 		 558 aa  1124    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.76 
 
 		 560 aa  866    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4641  ABC transporter related protein  84.77 
 
 		 558 aa  959    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310211  hitchhiker  0.00496143 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.73 
 
 		 584 aa  661    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.71 
 
 		 556 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0300  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.45 
 
 		 559 aa  779    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 		 549 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.35 
 
 		 551 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.36 
 
 		 560 aa  876    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1129  ABC transporter, ATP-binding protein YjiK  72.14 
 
 		 558 aa  813    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1442  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.88 
 
 		 559 aa  786    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.465539  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  60.18 
 
 		 559 aa  680    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 		 555 aa  669    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.44 
 
 		 670 aa  648    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.85 
 
 		 558 aa  907    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.35 
 
 		 555 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.06 
 
 		 557 aa  863    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 549 aa  648    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.23 
 
 		 556 aa  648    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.99 
 
 		 551 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7358  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.03 
 
 		 554 aa  899    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 561 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24710  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  75.76 
 
 		 560 aa  860    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0377191  normal  0.041371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.27 
 
 		 551 aa  646    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.39 
 
 		 555 aa  682    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.26 
 
 		 549 aa  658    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.99 
 
 		 555 aa  642    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 		 549 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 554 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.58 
 
 		 560 aa  865    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09750  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.15 
 
 		 560 aa  839    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.06 
 
 		 557 aa  863    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 561 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 		 560 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.79 
 
 		 558 aa  639    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.8 
 
 		 556 aa  834    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  79.57 
 
 		 554 aa  913    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 		 551 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.73 
 
 		 560 aa  813    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 560 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.06 
 
 		 557 aa  863    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 		 561 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.64 
 
 		 557 aa  881    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11480  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.44 
 
 		 560 aa  833    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2929  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.72 
 
 		 549 aa  654    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1816  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.78 
 
 		 559 aa  852    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.461866  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.75 
 
 		 555 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  58.45 
 
 		 563 aa  631  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.27 
 
 		 550 aa  631  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.46 
 
 		 549 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.93 
 
 		 555 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.5 
 
 		 559 aa  632  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>