More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1794 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  70.52 
 
 
555 aa  814    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  70.52 
 
 
555 aa  814    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.93 
 
 
559 aa  791    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.71 
 
 
555 aa  820    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
555 aa  1128    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.98 
 
 
555 aa  808    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.79 
 
 
549 aa  712    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.33 
 
 
559 aa  800    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.11 
 
 
549 aa  681    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3472  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.72 
 
 
555 aa  799    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  68.36 
 
 
563 aa  798    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.98 
 
 
555 aa  808    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.07 
 
 
559 aa  718    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1183  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.26 
 
 
554 aa  799    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.976373 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.54 
 
 
555 aa  796    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.89 
 
 
557 aa  853    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.07 
 
 
557 aa  856    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.35 
 
 
554 aa  803    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.08 
 
 
553 aa  801    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.35 
 
 
554 aa  790    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.69 
 
 
547 aa  681    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0552  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.08 
 
 
555 aa  802    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.13 
 
 
556 aa  875    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.62 
 
 
555 aa  786    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.71 
 
 
595 aa  813    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.93 
 
 
560 aa  724    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.97 
 
 
550 aa  726    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.54 
 
 
555 aa  796    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.85 
 
 
557 aa  891    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.44 
 
 
554 aa  810    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.89 
 
 
551 aa  712    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.61 
 
 
561 aa  755    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.26 
 
 
555 aa  801    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2084  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.8 
 
 
555 aa  806    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.695655  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.54 
 
 
555 aa  796    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.38 
 
 
549 aa  645    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.44 
 
 
551 aa  706    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3163  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.9 
 
 
555 aa  789    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.24 
 
 
559 aa  788    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.34 
 
 
555 aa  816    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.66 
 
 
561 aa  719    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.88 
 
 
556 aa  840    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.54 
 
 
555 aa  796    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.81 
 
 
554 aa  795    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.54 
 
 
555 aa  797    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.06 
 
 
559 aa  777    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.08 
 
 
555 aa  801    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.81 
 
 
554 aa  770    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.44 
 
 
560 aa  695    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 
549 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.08 
 
 
559 aa  694    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.44 
 
 
551 aa  688    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2608  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.97 
 
 
579 aa  769    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.234433  normal  0.107182 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.97 
 
 
553 aa  774    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.59 
 
 
553 aa  797    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.07 
 
 
549 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3519  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.43 
 
 
553 aa  765    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.876019  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.9 
 
 
555 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1245  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.7 
 
 
553 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1141  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.81 
 
 
555 aa  782    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776403  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.43 
 
 
549 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.61 
 
 
578 aa  834    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.16 
 
 
550 aa  714    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.08 
 
 
553 aa  801    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.8 
 
 
589 aa  811    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.71 
 
 
555 aa  690    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.9 
 
 
670 aa  696    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.54 
 
 
555 aa  796    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.44 
 
 
705 aa  806    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.82 
 
 
563 aa  682    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1296  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.17 
 
 
555 aa  792    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341182  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.07 
 
 
549 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.03 
 
 
556 aa  705    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.89 
 
 
551 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.54 
 
 
555 aa  796    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.65 
 
 
556 aa  823    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2781  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.72 
 
 
555 aa  801    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.957442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.72 
 
 
555 aa  800    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.53945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1159  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.72 
 
 
555 aa  800    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.47 
 
 
555 aa  927    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1032  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.63 
 
 
555 aa  785    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.94 
 
 
555 aa  696    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.9 
 
 
555 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1801  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.59 
 
 
553 aa  786    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.124805  normal  0.0665876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.44 
 
 
554 aa  809    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.11 
 
 
560 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.44 
 
 
555 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4758  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.63 
 
 
553 aa  768    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.28 
 
 
561 aa  748    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.69 
 
 
560 aa  783    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.72 
 
 
555 aa  801    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  63 
 
 
556 aa  686    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.88 
 
 
559 aa  758    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
558 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.16 
 
 
551 aa  704    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.86 
 
 
560 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1013  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.54 
 
 
555 aa  793    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.27 
 
 
561 aa  767    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1437  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.27 
 
 
554 aa  776    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.33 
 
 
553 aa  839    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>