More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1799 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  69.19 
 
 
555 aa  800    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  69.19 
 
 
555 aa  800    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 
559 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.73 
 
 
555 aa  814    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2608  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.81 
 
 
579 aa  884    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.234433  normal  0.107182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.35 
 
 
555 aa  790    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.46 
 
 
555 aa  927    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00997  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.03 
 
 
555 aa  778    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.69 
 
 
559 aa  800    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.19 
 
 
555 aa  800    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3472  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.86 
 
 
555 aa  758    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  69.33 
 
 
563 aa  806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1183  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.06 
 
 
554 aa  762    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.976373 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.56 
 
 
555 aa  916    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.38 
 
 
559 aa  650    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.56 
 
 
555 aa  916    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.01 
 
 
557 aa  773    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.83 
 
 
557 aa  770    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.68 
 
 
554 aa  812    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.25 
 
 
553 aa  770    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
554 aa  1140    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3162  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.86 
 
 
555 aa  744    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.322679  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.25 
 
 
553 aa  763    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.84 
 
 
555 aa  892    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.14 
 
 
595 aa  940    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.31 
 
 
550 aa  661    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3163  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.05 
 
 
555 aa  747    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.56 
 
 
555 aa  916    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.77 
 
 
557 aa  763    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.22 
 
 
554 aa  815    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.5 
 
 
551 aa  641    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.02 
 
 
561 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.38 
 
 
555 aa  914    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2084  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.53 
 
 
555 aa  888    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.695655  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.56 
 
 
555 aa  916    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.14 
 
 
551 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
559 aa  686    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.99 
 
 
555 aa  829    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.3 
 
 
561 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.47 
 
 
556 aa  807    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.56 
 
 
555 aa  916    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.56 
 
 
555 aa  916    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.53 
 
 
554 aa  897    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.5 
 
 
551 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 
559 aa  689    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.1 
 
 
555 aa  921    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.95 
 
 
554 aa  939    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.19 
 
 
555 aa  800    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.65 
 
 
555 aa  800    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.8 
 
 
551 aa  637    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.88 
 
 
556 aa  769    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.54 
 
 
553 aa  882    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.08 
 
 
553 aa  783    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.93 
 
 
551 aa  664    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3519  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.91 
 
 
553 aa  882    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.876019  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.2 
 
 
555 aa  914    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1801  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.99 
 
 
553 aa  914    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.124805  normal  0.0665876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1141  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.32 
 
 
555 aa  747    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1270  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.5 
 
 
555 aa  750    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.26 
 
 
578 aa  790    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
550 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.25 
 
 
553 aa  770    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.38 
 
 
589 aa  916    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 
555 aa  637    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 
670 aa  644    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1245  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.91 
 
 
553 aa  889    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.1 
 
 
705 aa  921    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4062  putative ABC transporter ATP-binding protein  82.31 
 
 
554 aa  946    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.247157  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1296  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.13 
 
 
555 aa  764    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341182  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4053  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.26 
 
 
553 aa  759    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.46 
 
 
556 aa  678    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.37 
 
 
559 aa  655    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.57 
 
 
555 aa  783    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.77 
 
 
556 aa  792    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0552  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.57 
 
 
555 aa  789    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.23 
 
 
555 aa  761    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.53945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1159  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.23 
 
 
555 aa  761    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.69 
 
 
555 aa  812    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1032  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.32 
 
 
555 aa  748    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
559 aa  664    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.02 
 
 
555 aa  908    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.56 
 
 
555 aa  916    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.49 
 
 
554 aa  811    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.48 
 
 
558 aa  686    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.1 
 
 
555 aa  919    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4758  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.27 
 
 
553 aa  888    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.04 
 
 
561 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.43 
 
 
560 aa  701    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.41 
 
 
555 aa  763    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.49 
 
 
579 aa  810    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 
559 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2781  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.86 
 
 
555 aa  758    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.957442  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.55 
 
 
551 aa  655    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.73 
 
 
555 aa  813    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1013  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.49 
 
 
555 aa  772    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 
561 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1437  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.79 
 
 
554 aa  772    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.76 
 
 
549 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.41 
 
 
553 aa  793    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.3 
 
 
560 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>